273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1328 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  100 
 
 		 114 aa  237  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  96.49 
 
 		 114 aa  229  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  82.88 
 
 		 115 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  79.65 
 
 		 115 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1391  hypothetical protein  90.99 
 
 		 118 aa  184  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  67.54 
 
 		 124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  67.54 
 
 		 124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  67.54 
 
 		 124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  67.54 
 
 		 124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  67.54 
 
 		 124 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  68.14 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  67.54 
 
 		 124 aa  159  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  66.67 
 
 		 124 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  65.79 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  63.16 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  61.4 
 
 		 123 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  63.16 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  62.28 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  61.4 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  61.4 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  61.4 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  61.4 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  61.4 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  58.04 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  58.41 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  56.64 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  56.25 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  57.14 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  54.46 
 
 		 116 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  53.98 
 
 		 115 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  57.41 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  49.11 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  50.43 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  45.69 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1272  hypothetical protein  54.78 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.903502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  52.73 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0590  arsenate reductase and related  50 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.419038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  47.32 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  50 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  55.96 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  53.1 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  54.05 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  52.29 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  55.45 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  58.04 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  54.55 
 
 		 118 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  54.55 
 
 		 118 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  54.55 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  54.63 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  47.32 
 
 		 117 aa  116  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  54.55 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  50.44 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  50.44 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  52.21 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  54.13 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  49.11 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1087  arsenate reductase and related  56.76 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.95059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  53.15 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  46.02 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  51.79 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  50.89 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  49.11 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  46.09 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  49.11 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  46.02 
 
 		 116 aa  114  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  49.12 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3375  arsenate reductase and related  47.83 
 
 		 135 aa  113  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956996  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  45.22 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  47.37 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  48.25 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  45.22 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  45.22 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  45.22 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  44.35 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  45.22 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  49.11 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  47.37 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  47.32 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  44.35 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  53.64 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  52.29 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  45.22 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  45.05 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  47.71 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  49.56 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  54.13 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  53.64 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2107  arsenate reductase and related  52.54 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.843624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  39.82 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  50.91 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  49.09 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  50.91 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  52.25 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  44.35 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  44.35 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  50 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  47.75 
 
 		 115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  47.37 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  44.35 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  47.75 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>