238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3058 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  100 
 
 		 116 aa  243  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  83.93 
 
 		 113 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  83.78 
 
 		 115 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  82.88 
 
 		 115 aa  199  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  81.82 
 
 		 115 aa  197  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  81.08 
 
 		 118 aa  196  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  83.78 
 
 		 121 aa  196  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  83.78 
 
 		 115 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  83.78 
 
 		 118 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  82.88 
 
 		 118 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  80 
 
 		 115 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  75.45 
 
 		 119 aa  177  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  70.54 
 
 		 121 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  72.48 
 
 		 118 aa  170  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  70.18 
 
 		 138 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  68.14 
 
 		 115 aa  168  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  68.18 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  70.27 
 
 		 118 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  65.79 
 
 		 115 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  66.37 
 
 		 116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  68.14 
 
 		 119 aa  163  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  67.57 
 
 		 115 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  60.53 
 
 		 116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  61.4 
 
 		 115 aa  153  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  59.29 
 
 		 116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  58.56 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  56.76 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  56.76 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3236  arsenate reductase and related  62.83 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.726187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  57.66 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  54.46 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  49.55 
 
 		 134 aa  133  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  49.55 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  49.55 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  49.55 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  48.65 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  48.65 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  47.75 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  48.65 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  49.12 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  50.44 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  50.93 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  50.44 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  46.85 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  50.94 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  49.09 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  48.21 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  51.4 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  45.37 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  49.55 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  53.98 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  51.35 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  49.09 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  49.11 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  53.21 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1829  arsenate reductase and related  50.83 
 
 		 121 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492435  unclonable  0.000000000467548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  52.83 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  53.1 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  53.1 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  48.65 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0578  hypothetical protein  55.67 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  48.7 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  49.56 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  50.96 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2038  arsenate reductase and related  53.54 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  48.21 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0590  arsenate reductase and related  47.32 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.419038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0567  hypothetical protein  54.64 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  43.64 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  52.29 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  46.02 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  47.79 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  46.28 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  46.9 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  46.9 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  48.74 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  46.9 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  46.9 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  48.62 
 
 		 115 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  46.9 
 
 		 124 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  48.74 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  48.15 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  47.79 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  50.45 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  50.45 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  48.18 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  50.45 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  50.45 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  51.4 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  50.45 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  46.02 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  46.28 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1087  arsenate reductase and related  51.92 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.95059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  43.75 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  53.7 
 
 		 119 aa  106  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  47.41 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  44.64 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  42.86 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>