236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3161 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  260  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  92 
 
 
125 aa  238  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  65.32 
 
 
127 aa  174  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  68.29 
 
 
121 aa  174  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  66.67 
 
 
132 aa  165  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  66.67 
 
 
132 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  66.67 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  64 
 
 
120 aa  164  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  61.16 
 
 
118 aa  150  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  61.98 
 
 
118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  61.16 
 
 
118 aa  150  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  61.16 
 
 
118 aa  150  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  61.16 
 
 
118 aa  150  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  61.16 
 
 
118 aa  150  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  61.16 
 
 
118 aa  150  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  60.33 
 
 
118 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  60.33 
 
 
118 aa  147  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  58.68 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  58.68 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  58.68 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2966  hypothetical protein  60.5 
 
 
115 aa  144  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  57.85 
 
 
118 aa  143  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  57.85 
 
 
118 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  52.99 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  45.53 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  49.18 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  52.14 
 
 
116 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  47.11 
 
 
116 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  47.11 
 
 
116 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  47.11 
 
 
116 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  51.28 
 
 
116 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  47.86 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  45.69 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  43.33 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  49.15 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  51.69 
 
 
115 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  47.54 
 
 
131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  49.18 
 
 
115 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  47.54 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  50.44 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  46.61 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  42.86 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  47.54 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  47.46 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  42.02 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  46.15 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  42.02 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  43.48 
 
 
114 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  42.02 
 
 
124 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  42.02 
 
 
124 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  42.02 
 
 
124 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  44.26 
 
 
116 aa  111  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  42.02 
 
 
124 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  47.54 
 
 
115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  43.09 
 
 
119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  42.37 
 
 
128 aa  110  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  46.28 
 
 
116 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  47.97 
 
 
121 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  46.61 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  47.15 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  47.15 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  45.53 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  40.83 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  44.54 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  46.22 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  47.15 
 
 
115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  45.76 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  41.18 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  43.22 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  42.02 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  42.02 
 
 
121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  43.8 
 
 
114 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  40.68 
 
 
116 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  42.74 
 
 
118 aa  106  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  105  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  40.65 
 
 
152 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  42.5 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  41.03 
 
 
118 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  46.09 
 
 
119 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  40.98 
 
 
152 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  38.33 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  46.61 
 
 
115 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  37.82 
 
 
123 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  42.5 
 
 
114 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2374  putative arsenate reductase  47.37 
 
 
100 aa  103  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  38.33 
 
 
122 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2038  arsenate reductase and related  40.34 
 
 
130 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  44.44 
 
 
115 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  45.3 
 
 
115 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  39.17 
 
 
122 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  39.17 
 
 
122 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  39.17 
 
 
122 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  38.33 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  38.33 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  40.16 
 
 
152 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  48.98 
 
 
117 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  43.48 
 
 
113 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  44.9 
 
 
124 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  41.88 
 
 
115 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  39.67 
 
 
120 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>