201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3142 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  276  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  276  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  97.73 
 
 
132 aa  270  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  71.43 
 
 
121 aa  181  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  69.91 
 
 
118 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  69.91 
 
 
118 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  66.67 
 
 
125 aa  165  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  69.91 
 
 
118 aa  165  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  69.03 
 
 
118 aa  164  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  69.03 
 
 
118 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  65 
 
 
125 aa  163  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  69.03 
 
 
118 aa  163  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  69.03 
 
 
118 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  69.03 
 
 
118 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  69.03 
 
 
118 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  67.54 
 
 
118 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  62.61 
 
 
127 aa  158  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  67.54 
 
 
118 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  67.54 
 
 
118 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  67.54 
 
 
118 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  66.67 
 
 
118 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2966  hypothetical protein  64.29 
 
 
115 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  59.13 
 
 
120 aa  146  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  52.59 
 
 
128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  53.51 
 
 
113 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  52.99 
 
 
116 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  50.86 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  54.95 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  53.04 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  53.04 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  56.88 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  51.3 
 
 
131 aa  124  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  46.72 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  53.57 
 
 
115 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  51.33 
 
 
118 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  52.73 
 
 
121 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  53.64 
 
 
115 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  49.57 
 
 
116 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  53.64 
 
 
116 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  49.56 
 
 
115 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  53.64 
 
 
115 aa  120  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  54.05 
 
 
116 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  51.28 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  48.21 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  54.05 
 
 
119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  48.67 
 
 
118 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  47.83 
 
 
114 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  47.71 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  51.79 
 
 
121 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  47.83 
 
 
119 aa  116  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  53.1 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  44.74 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  46.36 
 
 
116 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  47.71 
 
 
116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  51.38 
 
 
116 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  43.93 
 
 
118 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  48.65 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  47.32 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  49.54 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  46.3 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  45.61 
 
 
113 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  49.56 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  44.74 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  51.92 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3375  arsenate reductase and related  40.94 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956996  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3178  ArsC family protein  46.15 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00330614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  50.93 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  50.44 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  50.93 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  46.09 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0590  arsenate reductase and related  40.34 
 
 
124 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.419038  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3236  arsenate reductase and related  48.65 
 
 
117 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.726187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2038  arsenate reductase and related  47.71 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  50.46 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  49.56 
 
 
118 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  49.56 
 
 
118 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  50.93 
 
 
115 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1859  arsenate reductase  49.19 
 
 
132 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.983128  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  46.79 
 
 
121 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2107  arsenate reductase and related  54.74 
 
 
119 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.843624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  42.61 
 
 
114 aa  105  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  48.18 
 
 
126 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  49.09 
 
 
113 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  48.21 
 
 
115 aa  104  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  39.02 
 
 
124 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1272  hypothetical protein  45.61 
 
 
115 aa  103  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.903502  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  43.75 
 
 
120 aa  104  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  49.07 
 
 
115 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  41.03 
 
 
123 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  42.59 
 
 
121 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  40.34 
 
 
122 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  44.44 
 
 
115 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  39.5 
 
 
124 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  42.61 
 
 
126 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  39.5 
 
 
124 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  47.32 
 
 
114 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  39.5 
 
 
124 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  39.5 
 
 
124 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  39.5 
 
 
124 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>