246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1642 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  100 
 
 
119 aa  244  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  54.29 
 
 
112 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  50.94 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  52.34 
 
 
115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  47.66 
 
 
115 aa  116  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  46.85 
 
 
113 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  46.73 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  44.35 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  46.73 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  46.3 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  46.3 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  45.95 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  47.22 
 
 
114 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  45.28 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  45.79 
 
 
115 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  45.37 
 
 
132 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  43.93 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  43.93 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  46.3 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  44.86 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  46.73 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  47.41 
 
 
121 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  44.86 
 
 
134 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  44.86 
 
 
134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  43.93 
 
 
152 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  43.48 
 
 
116 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  43.93 
 
 
134 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  42.59 
 
 
114 aa  106  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  48.57 
 
 
131 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  43.93 
 
 
152 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  45.79 
 
 
116 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  43.24 
 
 
116 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  43.24 
 
 
114 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  44.86 
 
 
121 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  43.24 
 
 
116 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  42.34 
 
 
113 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  45.76 
 
 
118 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  45.95 
 
 
115 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  43.4 
 
 
114 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  42.59 
 
 
116 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  41.9 
 
 
116 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  45.87 
 
 
121 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  42.73 
 
 
121 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  44.34 
 
 
119 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  43.64 
 
 
118 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  49.46 
 
 
117 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0559  hypothetical protein  46.9 
 
 
112 aa  103  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401537  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  43.64 
 
 
118 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  42.45 
 
 
118 aa  103  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  43.64 
 
 
118 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  43.64 
 
 
118 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  42.59 
 
 
127 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  43.4 
 
 
115 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  41.82 
 
 
118 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  43.64 
 
 
118 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  43.64 
 
 
115 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  41.82 
 
 
125 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  41.67 
 
 
118 aa  100  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  38.05 
 
 
117 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  41.67 
 
 
120 aa  100  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  42.06 
 
 
135 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  43.93 
 
 
114 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3178  ArsC family protein  39.13 
 
 
116 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00330614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2038  arsenate reductase and related  42.45 
 
 
130 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  40.18 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  44.34 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  42.73 
 
 
115 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  41.8 
 
 
128 aa  98.6  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  40.74 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  43.24 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  40.57 
 
 
118 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  37.84 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  40.74 
 
 
118 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  39.62 
 
 
121 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3236  arsenate reductase and related  42.99 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.726187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0590  arsenate reductase and related  38.94 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.419038  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3375  arsenate reductase and related  40 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956996  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  40.98 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  39.62 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  39.62 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1552  ArsC family protein  46.81 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  37.04 
 
 
114 aa  94.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  41.59 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  42.06 
 
 
118 aa  94  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0094  hypothetical protein  44.95 
 
 
118 aa  94  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  38.68 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2966  hypothetical protein  41.67 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1277  arsenate reductase and related  45.79 
 
 
123 aa  93.6  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300917  normal  0.698716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  37.74 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01143  ArsC family protein  43.52 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.013195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  41.67 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  37.82 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1272  hypothetical protein  43.1 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.903502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>