244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01143 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01143  ArsC family protein  100 
 
 
118 aa  246  9e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.013195  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0094  hypothetical protein  78.81 
 
 
118 aa  206  7e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0080  arsenate reductase and related  78.81 
 
 
118 aa  202  9e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1277  arsenate reductase and related  79.31 
 
 
123 aa  202  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300917  normal  0.698716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  43.59 
 
 
125 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  43.52 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  42.98 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  43.36 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  42.11 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  41.88 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  41.12 
 
 
115 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  41.74 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  40 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  42.11 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  41.23 
 
 
121 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2038  arsenate reductase and related  39.29 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  39.13 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  40.52 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  38.46 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  41.59 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  38.26 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  40.35 
 
 
113 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  42.98 
 
 
114 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  39.13 
 
 
126 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  37.72 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  38.98 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  38.98 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  38.26 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  38.98 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  43.01 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  38.6 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  38.98 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  41.23 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  38.6 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  37.93 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  39.82 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  39.13 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  38.98 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  38.98 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  38.98 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  41.94 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  38.14 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  36.84 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  38.26 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  36.61 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  38.26 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  40.87 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  38.6 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  36.75 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  40.2 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  35.9 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  37.07 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  36.75 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  43.01 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  38.61 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  35.9 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3236  arsenate reductase and related  41.23 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.726187 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  37.84 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  35.9 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  37.84 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  37.07 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  37.07 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  37.07 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  37.07 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  37.84 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  37.07 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  35.9 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  35.04 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3178  ArsC family protein  37.07 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00330614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  35.04 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  39.78 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  38.26 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  33.04 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  35.34 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  38.79 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  35.65 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  36.21 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  33.63 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  36.7 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  34.48 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  34.21 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  36.21 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  35.34 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  37.27 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  34.78 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  36.61 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  35.34 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  35.34 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  35.09 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  38.71 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1391  hypothetical protein  37.72 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  35.34 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  38.71 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  33.62 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  33.62 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  41.67 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  38.71 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  38.71 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>