251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1277 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1277  arsenate reductase and related  100 
 
 
123 aa  255  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300917  normal  0.698716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01143  ArsC family protein  79.31 
 
 
118 aa  202  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.013195  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0094  hypothetical protein  73.28 
 
 
118 aa  194  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0080  arsenate reductase and related  71.55 
 
 
118 aa  186  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  43.97 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  41.88 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  48 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  45.79 
 
 
119 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  41.88 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  42.11 
 
 
120 aa  92.8  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  44.95 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  41.18 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  43.59 
 
 
115 aa  90.1  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  44.54 
 
 
124 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  42.48 
 
 
113 aa  90.1  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  40.52 
 
 
119 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  41.88 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  40.17 
 
 
115 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  40.34 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  42.98 
 
 
114 aa  87.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  40.52 
 
 
115 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  42.61 
 
 
114 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  43.7 
 
 
124 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  43.7 
 
 
124 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  43.7 
 
 
124 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  43.7 
 
 
124 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  43.7 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  40.17 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2038  arsenate reductase and related  40.71 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  39.32 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  41.03 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  42.37 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  40.17 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  38.46 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  38.6 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  39.13 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  40.52 
 
 
118 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  42.86 
 
 
124 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  37.61 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  43.62 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  40.87 
 
 
114 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  41.23 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  37.93 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  38.02 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  39.13 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  41.23 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  36.52 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  37.82 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  43.01 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  39.32 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  40 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  39.09 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  43.75 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  37.93 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  41 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  39.09 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  39.09 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3236  arsenate reductase and related  40.68 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.726187 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  38.26 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  39.32 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  41.07 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  35.34 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  38.26 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  38.26 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  35.29 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  38.26 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  35.59 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  35.59 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  36.52 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  38.26 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0567  hypothetical protein  41.84 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  37.93 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  38.26 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  38.26 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  38.26 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  38.26 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  36.84 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  37.39 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  33.61 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  36.52 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  36.52 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  35.29 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1391  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1829  arsenate reductase and related  38.84 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492435  unclonable  0.000000000467548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  33.61 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  37.72 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  35.29 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  36.75 
 
 
123 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1290  hypothetical protein  33.63 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  38.46 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  35.29 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  38.46 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  36.52 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  36.52 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>