255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0011 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  233  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  53.91 
 
 
118 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  53.91 
 
 
116 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  47.83 
 
 
131 aa  131  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  53.91 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  57.66 
 
 
116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  54.39 
 
 
116 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  52.63 
 
 
116 aa  130  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  51.3 
 
 
115 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  56.6 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  56.6 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  51.3 
 
 
138 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  53.45 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  51.72 
 
 
128 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  44.74 
 
 
116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  48.7 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1087  arsenate reductase and related  53.64 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.95059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  48.25 
 
 
115 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  52.17 
 
 
115 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  46.09 
 
 
117 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1829  arsenate reductase and related  51.67 
 
 
121 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492435  unclonable  0.000000000467548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  53.15 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  45.13 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  50.43 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  50.43 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0567  hypothetical protein  46.34 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  54.95 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  50.43 
 
 
115 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  50 
 
 
115 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  50.43 
 
 
121 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  47.79 
 
 
115 aa  114  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  51.3 
 
 
115 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  47.22 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  49.56 
 
 
116 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  48.65 
 
 
119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  45.54 
 
 
116 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  45.54 
 
 
116 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  47.37 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  50.88 
 
 
131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0578  hypothetical protein  47.15 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  49.56 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  49.02 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  46.09 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  47.37 
 
 
115 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  42.86 
 
 
114 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  47.27 
 
 
114 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  51.72 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0590  arsenate reductase and related  45.69 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.419038  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  47.75 
 
 
114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  46.02 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  48.65 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3375  arsenate reductase and related  46.15 
 
 
135 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956996  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  45.37 
 
 
114 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  45.28 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  50.86 
 
 
122 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  50.86 
 
 
122 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  50.86 
 
 
122 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  39.13 
 
 
115 aa  107  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  47.17 
 
 
121 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1859  arsenate reductase  51.72 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.983128  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  45.3 
 
 
120 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  46.36 
 
 
113 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  41.59 
 
 
113 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  49.06 
 
 
118 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  49.14 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  49.14 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  49.14 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  41.67 
 
 
126 aa  104  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  41.51 
 
 
116 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  48.25 
 
 
124 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  48.25 
 
 
124 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  48.25 
 
 
124 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  48.25 
 
 
124 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  48.25 
 
 
124 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2374  putative arsenate reductase  49.44 
 
 
100 aa  103  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  47.83 
 
 
122 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1272  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.903502  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  38.26 
 
 
117 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  42.73 
 
 
118 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  42.73 
 
 
118 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  42.73 
 
 
118 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  39.13 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  42.73 
 
 
118 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  42.99 
 
 
121 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  42.86 
 
 
120 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  40.91 
 
 
114 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  47.79 
 
 
124 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  41.82 
 
 
121 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  47.37 
 
 
124 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  42.73 
 
 
118 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  42.73 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  45.13 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  42.73 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2038  arsenate reductase and related  48.11 
 
 
130 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  46.02 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  44.23 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>