236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1290 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1290  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  233  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  52.73 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  49.55 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  50.45 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  47.75 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  46.36 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  45.95 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  45.95 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  44.55 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  45.05 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  44.14 
 
 		 114 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  45.95 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  44.14 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  43.12 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  45.95 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  39.64 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  45.05 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  44.55 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  44.14 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  37.84 
 
 		 115 aa  103  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  42.73 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  38.18 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  34.23 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  38.74 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  42.11 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  41.44 
 
 		 115 aa  99.4  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  38.53 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  39.82 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  41.23 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  39.42 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  43.36 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  35.14 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  42.48 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  42.48 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  33.33 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  42.48 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  41.59 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  41.59 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  35.71 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  41.59 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  39.82 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  39.82 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  39.64 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  39.82 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  39.82 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  40.54 
 
 		 119 aa  96.7  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  39.82 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  39.82 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  40.18 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  39.82 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  39.64 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  36.04 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  35.45 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  39.82 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  38.94 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3178  ArsC family protein  41.23 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00330614  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  39.64 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  38.94 
 
 		 124 aa  93.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  34.55 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  35.65 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  35.65 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  35.65 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  38.05 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  35.65 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  33.33 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  35.34 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  34.78 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  36.94 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  34.23 
 
 		 116 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  35.71 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  35.14 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  36.94 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  34.78 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  35.45 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  35.14 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  34.78 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  34.78 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  36.11 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  34.78 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2374  putative arsenate reductase  44.57 
 
 		 100 aa  90.9  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  36.11 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  33.64 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  33.03 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1391  hypothetical protein  40.54 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  35.45 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  35.45 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  33.91 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  33.64 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  33.04 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  36.94 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  36.94 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  36.94 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  34.91 
 
 		 118 aa  87.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  33.33 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  34.55 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  36.45 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  30.09 
 
 		 119 aa  86.7  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  37.84 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  32.17 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>