81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1192 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1192  nitrogenase-associated protein  100 
 
 		 131 aa  270  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1054  nitrogenase-associated protein  76.74 
 
 		 130 aa  203  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1186  nitrogenase-associated protein  76.15 
 
 		 130 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4315  nitrogenase-associated protein  62.99 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00428414  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0471  nitrogenase-associated protein  59.5 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3773  nitrogenase-associated protein  59.83 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2504  nitrogenase-associated protein  62.71 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2631  nitrogenase-associated protein  55.56 
 
 		 157 aa  154  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1764  nitrogenase-associated protein  57.14 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1840  nitrogenase-associated protein  52.8 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0511  nitrogenase-associated protein  59.32 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0223  nitrogenase-associated protein  61.21 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1007  nitrogenase-associated protein  54.33 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353032  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0145  nitrogenase-associated protein  56.25 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4806  nitrogenase-associated protein  53.72 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1208  nitrogenase-associated protein  52.27 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1800  nitrogenase-associated protein  51.2 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.663505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1772  nitrogenase-associated protein  51.2 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0451  nitrogenase-associated protein  58.97 
 
 		 171 aa  136  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0427  nitrogenase-associated protein  48.82 
 
 		 143 aa  133  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109972  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1460  nitrogenase-associated protein  54.2 
 
 		 161 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51030  nitrogenase-associated protein  56.19 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0511057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5881  putative arsenate reductase (nitrogenase-associated protein)  55.26 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0819125  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  54.05 
 
 		 462 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  54.05 
 
 		 462 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1452  nitrogenase-associated protein  55.08 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1555  nitrogenase-associated protein  44.27 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.65637  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2105  nitrogenase-associated protein  46.55 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.980388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29330  hypothetical protein  45.31 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1650  nitrogenase-associated protein  44.36 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2351  nitrogenase-associated protein  54.55 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0911  nitrogenase-associated protein  39.72 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1060  nitrogenase-associated protein  46.6 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.0000873052 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0702  transcriptional regulator Spx  25.38 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0996  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00113345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3423  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  33.33 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3456  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3422  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3109  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3181  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3202  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0489409  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0567  arsenate reductase and related  22.41 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3411  transcriptional regulator Spx  23.01 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000835539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0545  arsenate reductase  25.44 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2271  arsenate reductase  28.12 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3434  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1359  arsenate reductase  22.81 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00176431  normal  0.0126888 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1485  arsenate reductase  30.19 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000184523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2278  arsenate reductase and related protein  25 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  31.96 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  26.42 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05691  putative arsenate reductase  25 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  26.55 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1835  transcriptional regulator Spx  23.01 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.27338  normal  0.376442 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0237  arsenate reductase and related  26.67 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.323435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1618  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3587  arsenate reductase and related  26.05 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000181597  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3085  arsenate reductase and related protein  27.27 
 
 		 121 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5134  hypothetical protein  26.05 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5131  hypothetical protein  26.05 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000307731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5098  hypothetical protein  26.05 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5229  hypothetical protein  26.05 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000111635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4860  hypothetical protein  26.05 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00587583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4701  arsenate reductase  26.05 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000403452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4717  arsenate reductase  26.05 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000794506  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1564  hypothetical protein  27.36 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  26.67 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5135  arsenate reductase related protein  30.51 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2504  arsenate reductase and related  29.2 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0104  hypothetical protein  26.05 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000725895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5136  hypothetical protein  26.05 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00116769  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1015  transcriptional regulator Spx  20.35 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000679905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0996  transcriptional regulator Spx  20.35 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.444698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0763  transcriptional regulator Spx  23.01 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4815  arsenate reductase and related  26.05 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000608235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0576  transcriptional regulator Spx  20.35 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.926413  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1002  arsenate reductase  26.04 
 
 		 118 aa  40  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0017766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  25.96 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  28.04 
 
 		 121 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  27.36 
 
 		 117 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>