82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1002 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1002  arsenate reductase  100 
 
 
118 aa  239  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0017766  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0996  transcriptional regulator Spx  76.72 
 
 
137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0545  arsenate reductase  70.59 
 
 
128 aa  155  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0567  arsenate reductase and related  57.69 
 
 
133 aa  131  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1359  arsenate reductase  57.43 
 
 
133 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00176431  normal  0.0126888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0763  transcriptional regulator Spx  56.19 
 
 
132 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1618  transcriptional regulator Spx  55.24 
 
 
132 aa  124  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0996  transcriptional regulator Spx  54.81 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.444698  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1015  transcriptional regulator Spx  54.81 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000679905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1097  transcriptional regulator Spx  54.29 
 
 
131 aa  123  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0576  transcriptional regulator Spx  53.85 
 
 
131 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.926413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1309  transcriptional regulator Spx  53.33 
 
 
131 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4100  transcriptional regulator Spx  53.33 
 
 
131 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1270  transcriptional regulator Spx  53.33 
 
 
131 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1242  transcriptional regulator Spx  53.33 
 
 
131 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1200  transcriptional regulator Spx  53.33 
 
 
131 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1347  transcriptional regulator Spx  53.33 
 
 
131 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0109883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1085  transcriptional regulator Spx  53.33 
 
 
131 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1091  transcriptional regulator Spx  53.33 
 
 
131 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0904  transcriptional regulator Spx  53.33 
 
 
131 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.873656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1109  transcriptional regulator Spx  53.33 
 
 
131 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1704  arsenate reductase  50.45 
 
 
144 aa  116  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0911  arsenate reductase  47.17 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0335675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1835  transcriptional regulator Spx  53.61 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.27338  normal  0.376442 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3434  transcriptional regulator Spx  53.61 
 
 
131 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3423  transcriptional regulator Spx  53.61 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3411  transcriptional regulator Spx  53.61 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000835539  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0078  transcriptional regulator Spx  44.55 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3456  transcriptional regulator Spx  51.55 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3202  transcriptional regulator Spx  51.55 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0489409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3181  transcriptional regulator Spx  51.55 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3109  transcriptional regulator Spx  51.55 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3422  transcriptional regulator Spx  51.55 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0702  transcriptional regulator Spx  41.82 
 
 
132 aa  103  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2092  transcriptional regulator Spx  40 
 
 
132 aa  100  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00819419  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1157  arsenate reductase  48.08 
 
 
130 aa  100  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.626027  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1446  arsenate reductase  43.12 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.374472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1363  arsenate reductase  41.58 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5711  arsenate reductase and related  29.57 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.494712  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3621  regulatory protein spx, putative  29.57 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0744  arsenate reductase  25.56 
 
 
118 aa  57  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000148038  hitchhiker  0.000145224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2009  arsenate reductase and related  26.37 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000123591  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05691  putative arsenate reductase  36.25 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0167  hypothetical protein  38.75 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2278  arsenate reductase and related protein  25 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0722  arsenate reductase-like protein  25.97 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0513  hypothetical protein  33.75 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.752698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  36.07 
 
 
116 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1227  arsenate reductase-like protein  26.67 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0377226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  31.25 
 
 
126 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05391  putative arsenate reductase  35 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1295  hypothetical protein  38.1 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.230317  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  26.74 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0206  arsenate reductase and related  29.29 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1896  arsenate reductase  28.05 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  30 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  26.92 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  35.59 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  33.87 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  33.87 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  29.27 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3085  arsenate reductase and related protein  26.04 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3587  arsenate reductase and related  23.96 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000181597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  27.69 
 
 
113 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  35.59 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0237  arsenate reductase and related  23.33 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.323435 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05761  putative arsenate reductase  30.12 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  24.21 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  33.87 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  28.05 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0484  hypothetical protein  24.18 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  28.05 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  27.78 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  30.65 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  25.61 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  25.61 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  31.15 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  29.27 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  25.61 
 
 
116 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  25.61 
 
 
116 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1192  nitrogenase-associated protein  26.04 
 
 
131 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  35.09 
 
 
135 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>