More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3399 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  100 
 
 
116 aa  229  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  62.07 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  61.21 
 
 
317 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  60.34 
 
 
141 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  60.34 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  58.62 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0989  arsenate reductase ArsC, putative  58.26 
 
 
115 aa  130  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  58.26 
 
 
136 aa  130  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  57.76 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0957  arsenate reductase  58.26 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  58.62 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  56.9 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  57.39 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  55.17 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2243  arsenate reductase  56.9 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  56.03 
 
 
142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  56.52 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  55.17 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  56.9 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  54.31 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  56.52 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  57.76 
 
 
139 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  54.31 
 
 
134 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2534  arsenate reductase  56.9 
 
 
121 aa  124  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  53.04 
 
 
143 aa  123  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  54.78 
 
 
152 aa  123  9e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  54.31 
 
 
141 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1961  arsenate reductase  57.52 
 
 
148 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2964  arsenate reductase  54.46 
 
 
115 aa  123  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0847246  normal  0.0110665 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  54.31 
 
 
143 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1910  arsenate reductase  54.31 
 
 
141 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  53.45 
 
 
141 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  53.1 
 
 
117 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  52.17 
 
 
137 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  55.75 
 
 
140 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  54.31 
 
 
141 aa  120  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  55.17 
 
 
146 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  54.87 
 
 
143 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5671  arsenate reductase  54.78 
 
 
140 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229186  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  55.26 
 
 
142 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0102  arsenate reductase  52.59 
 
 
141 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  56.03 
 
 
140 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  53.45 
 
 
141 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1379  arsenate reductase  53.45 
 
 
145 aa  120  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2198  arsenate reductase  55.65 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  54.95 
 
 
116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  56.64 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.662339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  56.03 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  53.85 
 
 
143 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  53.45 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  52.59 
 
 
145 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  51.72 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  52.59 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1181  arsenate reductase  52.68 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2389  arsenate reductase  51.3 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  54.87 
 
 
140 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5710  arsenate reductase  52.17 
 
 
140 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  51.72 
 
 
139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  49.14 
 
 
140 aa  113  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  53.57 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3830  arsenate reductase  50 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.720829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  53.91 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2345  arsenate reductase  50 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  hitchhiker  0.00279499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1852  arsenate reductase  48.72 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  50.43 
 
 
116 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4072  arsenate reductase  57.76 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  51.38 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  53.98 
 
 
140 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3986  arsenate reductase  49.57 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1214  arsenate reductase  50 
 
 
151 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  49.57 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0211  arsenate reductase  49.57 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3705  arsenate reductase  49.57 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.556229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  50 
 
 
114 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  49.57 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  49.57 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  49.57 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  48.7 
 
 
117 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0718  arsenate reductase  48.7 
 
 
141 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0377236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  49.57 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  48.67 
 
 
142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0826  arsenate reductase  49.55 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295168  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3564  arsenate reductase  49.12 
 
 
125 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6300  arsenate reductase  49.57 
 
 
140 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.743402  normal  0.39419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3795  arsenate reductase  48.7 
 
 
141 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.256132 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4257  arsenate reductase  45.22 
 
 
141 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  48.7 
 
 
141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  49.57 
 
 
117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  48.7 
 
 
117 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2315  arsenate reductase  53.1 
 
 
140 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509444  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  52.21 
 
 
276 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2887  arsenate reductase  50.45 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  46.96 
 
 
115 aa  106  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4784  arsenate reductase  52.25 
 
 
113 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.375449  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  49.11 
 
 
118 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1283  arsenate reductase  52.21 
 
 
140 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.884735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0915  arsenate reductase  51.3 
 
 
125 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.435432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  46.55 
 
 
116 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  47.75 
 
 
116 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  45.54 
 
 
116 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>