288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2520 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  100 
 
 
116 aa  230  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  65.49 
 
 
116 aa  157  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  63.72 
 
 
118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  65.79 
 
 
117 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  64.91 
 
 
121 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  63.16 
 
 
117 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  64.04 
 
 
117 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  59.13 
 
 
116 aa  146  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  60.34 
 
 
119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  60.34 
 
 
119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  60.34 
 
 
119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  60.34 
 
 
119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  60.34 
 
 
119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  60.34 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  63.16 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  60.34 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  63.16 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  62.28 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  61.74 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  60.34 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  59.48 
 
 
119 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  59.48 
 
 
119 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  59.48 
 
 
119 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  59.48 
 
 
119 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  61.61 
 
 
116 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  62.5 
 
 
116 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  62.5 
 
 
116 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  59.48 
 
 
119 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  61.61 
 
 
116 aa  141  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  62.83 
 
 
116 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  60.71 
 
 
116 aa  141  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  61.61 
 
 
116 aa  140  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  61.61 
 
 
116 aa  140  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2979  arsenate reductase  58.62 
 
 
119 aa  140  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.757259  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  59.65 
 
 
117 aa  140  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  60.71 
 
 
116 aa  139  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  61.26 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  59.82 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  59.29 
 
 
122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  60.53 
 
 
117 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  59.48 
 
 
125 aa  137  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  60.18 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  59.13 
 
 
123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  56.9 
 
 
116 aa  137  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  57.02 
 
 
116 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3436  arsenate reductase  57.63 
 
 
119 aa  133  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  57.66 
 
 
120 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  58.41 
 
 
117 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  58.77 
 
 
120 aa  133  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  56.14 
 
 
121 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3271  arsenate reductase  53.39 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  56.14 
 
 
117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  58.77 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  58.26 
 
 
118 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  58.26 
 
 
118 aa  130  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  58.26 
 
 
118 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  54.31 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  56.03 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  54.39 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  53.91 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  56.52 
 
 
117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  56.78 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  54.78 
 
 
141 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  53.98 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4150  arsenate reductase  53.39 
 
 
123 aa  123  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572754  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  53.91 
 
 
134 aa  123  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  54.31 
 
 
118 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  54.31 
 
 
118 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  53.91 
 
 
141 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  54.31 
 
 
118 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  52.17 
 
 
138 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4964  arsenate reductase  55.08 
 
 
119 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000180468  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  51.3 
 
 
132 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  53.91 
 
 
139 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  53.04 
 
 
140 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  49.14 
 
 
152 aa  121  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0826  arsenate reductase  55.36 
 
 
125 aa  121  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295168  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5167  arsenate reductase  53.39 
 
 
119 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000109788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  53.51 
 
 
116 aa  121  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5692  arsenate reductase  53.39 
 
 
119 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000484398  hitchhiker  0.00107308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  52.17 
 
 
142 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  53.51 
 
 
140 aa  120  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  47.83 
 
 
140 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  53.51 
 
 
142 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  52.17 
 
 
317 aa  120  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2385  putative arsenate reductase  52.59 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  53.04 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  48.7 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  50.43 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4544  arsenate reductase  53.39 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001485  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2408  arsenate reductase  53.45 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00110254  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2113  arsenate reductase  53.45 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0142816  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  48.28 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0006  arsenate reductase  55.08 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000819049  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1421  arsenate reductase  53.45 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245055  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2370  arsenate reductase  52.59 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000151133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  50.43 
 
 
134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1142  arsenate reductase  53.45 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  51.3 
 
 
140 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1961  arsenate reductase  50.88 
 
 
148 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>