255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2887 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2887  arsenate reductase  100 
 
 
118 aa  230  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3564  arsenate reductase  97.46 
 
 
125 aa  224  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  73.45 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0915  arsenate reductase  67.26 
 
 
125 aa  150  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.435432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1283  arsenate reductase  53.04 
 
 
140 aa  127  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.884735  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  55.75 
 
 
121 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  49.15 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  54.87 
 
 
117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  53.91 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  53.98 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  55.75 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  54.87 
 
 
134 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2315  arsenate reductase  53.51 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509444  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  53.04 
 
 
142 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  53.98 
 
 
117 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  53.98 
 
 
143 aa  123  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  53.04 
 
 
140 aa  123  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  53.1 
 
 
117 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  50 
 
 
134 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  52.21 
 
 
141 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2534  arsenate reductase  51.75 
 
 
121 aa  121  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  51.75 
 
 
139 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  49.12 
 
 
132 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  51.28 
 
 
121 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1852  arsenate reductase  49.57 
 
 
127 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  53.98 
 
 
145 aa  120  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  51.33 
 
 
141 aa  120  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  52.21 
 
 
117 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  53.1 
 
 
141 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  52.21 
 
 
117 aa  120  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5671  arsenate reductase  53.1 
 
 
140 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229186  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  50.44 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  51.3 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  51.33 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1910  arsenate reductase  51.33 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  52.21 
 
 
145 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  50.88 
 
 
116 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6300  arsenate reductase  51.3 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.743402  normal  0.39419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  51.33 
 
 
142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  54.05 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0102  arsenate reductase  50.44 
 
 
141 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5710  arsenate reductase  51.33 
 
 
140 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  50.44 
 
 
143 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  47.86 
 
 
152 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  51.33 
 
 
317 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  52.63 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  51.33 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1379  arsenate reductase  50.44 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  49.12 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6564  arsenate reductase  50.43 
 
 
140 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  51.33 
 
 
141 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  50.43 
 
 
120 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  52.21 
 
 
141 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  50 
 
 
118 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2288  arsenate reductase  51.3 
 
 
143 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  hitchhiker  0.00391371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  51.75 
 
 
140 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  46.96 
 
 
116 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  50.44 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  49.11 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  50.45 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2198  arsenate reductase  47.37 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  50.44 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  49.56 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  50.43 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  51.69 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  48.25 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  48.67 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  48.7 
 
 
276 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3271  arsenate reductase  55.56 
 
 
119 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  48.67 
 
 
138 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0989  arsenate reductase ArsC, putative  48.67 
 
 
115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  49.57 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  47.79 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  47.83 
 
 
116 aa  110  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3436  arsenate reductase  54.7 
 
 
119 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  47.79 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  50.45 
 
 
139 aa  110  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  46.9 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  50 
 
 
123 aa  110  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3830  arsenate reductase  44.44 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.720829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  46.9 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  48.67 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0957  arsenate reductase  47.79 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  46.96 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2345  arsenate reductase  44.44 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  hitchhiker  0.00279499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  50.44 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.662339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  46.96 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0211  arsenate reductase  46.96 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3705  arsenate reductase  46.96 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.556229  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  50 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1214  arsenate reductase  45.61 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  46.96 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2370  arsenate reductase  51.72 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000151133  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  46.96 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  47.79 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  45.95 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  50 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  50 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  46.96 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  47.83 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>