More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1207 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  100 
 
 
117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  92.31 
 
 
121 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  89.74 
 
 
117 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  89.74 
 
 
117 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  81.9 
 
 
121 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  81.2 
 
 
117 aa  190  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  78.63 
 
 
117 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  78.63 
 
 
117 aa  187  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  76.92 
 
 
117 aa  179  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  75.86 
 
 
117 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  73.28 
 
 
117 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  68.38 
 
 
118 aa  154  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  65.79 
 
 
116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  60.34 
 
 
116 aa  147  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  62.83 
 
 
117 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  60.34 
 
 
116 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  61.21 
 
 
116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  61.21 
 
 
116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  60.34 
 
 
116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  62.39 
 
 
117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  62.28 
 
 
118 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  60.34 
 
 
116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  60.34 
 
 
116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  59.65 
 
 
118 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  58.77 
 
 
120 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  61.54 
 
 
118 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  61.54 
 
 
118 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  61.54 
 
 
118 aa  141  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  58.62 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  53.51 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  56.9 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  58.62 
 
 
123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  57.89 
 
 
116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  58.26 
 
 
125 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  55.56 
 
 
117 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  58.56 
 
 
120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  58.56 
 
 
120 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  58.77 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  58.77 
 
 
119 aa  131  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  58.77 
 
 
119 aa  131  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  58.77 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  56.03 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  58.77 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  57.76 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  58.77 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  58.77 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  57.89 
 
 
119 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  56.9 
 
 
116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  58.12 
 
 
117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  56.78 
 
 
119 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  56.78 
 
 
119 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  56.78 
 
 
119 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  56.78 
 
 
119 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  56.78 
 
 
119 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2979  arsenate reductase  57.63 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.757259  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  59.82 
 
 
116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  54.31 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2385  putative arsenate reductase  51.3 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  53.45 
 
 
120 aa  124  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3564  arsenate reductase  52.63 
 
 
125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  53.45 
 
 
116 aa  124  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2887  arsenate reductase  53.1 
 
 
118 aa  123  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  52.17 
 
 
116 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2370  arsenate reductase  57.14 
 
 
118 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000151133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  47.41 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  52.17 
 
 
142 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  54.24 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  54.24 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  54.24 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1207  arsenate reductase  49.57 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0485928  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  48.21 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2964  arsenate reductase  56.64 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0847246  normal  0.0110665 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  50.89 
 
 
114 aa  114  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1142  arsenate reductase  53.39 
 
 
118 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2113  arsenate reductase  53.39 
 
 
118 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0142816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1421  arsenate reductase  53.39 
 
 
118 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  49.14 
 
 
116 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2408  arsenate reductase  53.39 
 
 
118 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00110254  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1881  arsenate reductase  49.56 
 
 
113 aa  113  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3436  arsenate reductase  51.28 
 
 
119 aa  113  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  51.75 
 
 
113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3271  putative arsenate reductase oxidoreductase protein  53.1 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  48.72 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  50.43 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  47.83 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0826  arsenate reductase  49.14 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295168  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3030  arsenate reductase  49.56 
 
 
119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26931  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1896  arsenate reductase  50.86 
 
 
115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  47.86 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  47.86 
 
 
143 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  48.7 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3271  arsenate reductase  46.15 
 
 
119 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  47.86 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  47.86 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  48.67 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  47.86 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  47.86 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  47.86 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3986  arsenate reductase  47.86 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2883  arsenate reductase  50.42 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>