267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3271 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3271  putative arsenate reductase oxidoreductase protein  100 
 
 		 134 aa  268  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3141  arsenate reductase  77.97 
 
 		 116 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3469  arsenate reductase and related  77.97 
 
 		 116 aa  187  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4150  arsenate reductase  50.43 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3436  arsenate reductase  53.85 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2370  arsenate reductase  52.54 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000151133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3271  arsenate reductase  53.04 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3030  arsenate reductase  50.43 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  52.54 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  52.54 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  52.54 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  51.69 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4964  arsenate reductase  51.69 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000180468  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4544  arsenate reductase  50.85 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5167  arsenate reductase  50.85 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000109788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5692  arsenate reductase  50.85 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000484398  hitchhiker  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7012  arsenate reductase  51.35 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132102  hitchhiker  0.00599586 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1421  arsenate reductase  51.69 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245055  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2113  arsenate reductase  51.69 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2408  arsenate reductase  51.69 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00110254  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1142  arsenate reductase  51.69 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  53.04 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0006  arsenate reductase  53.45 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000819049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  52.17 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  53.1 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  53.1 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  52.21 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  53.1 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  51.26 
 
 		 117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  49.58 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  53.1 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  51.33 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  49.58 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  50.43 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  47.06 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3163  arsenate reductase  50 
 
 		 119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000451788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  51.3 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  47.83 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  48.74 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0826  arsenate reductase  50.83 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  46.96 
 
 		 118 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  48.74 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  48.72 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  48.72 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  48.7 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  48.72 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  43.86 
 
 		 122 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  45.38 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  47.06 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  43.36 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  44.92 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  48.21 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  46.49 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  47.32 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  44.54 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  44.54 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  47.32 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  47.32 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  47.32 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  43.36 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  44.54 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  44.54 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  46.49 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2385  putative arsenate reductase  45.22 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  43.36 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  47.79 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  44.54 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  42.02 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  46.43 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  46.09 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  45.54 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  46.02 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  46.02 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  46.02 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  46.02 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  44.63 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  46.02 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  44.44 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1073  arsenate reductase  41.67 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0830034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  46.36 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  42.61 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  46.53 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1896  arsenate reductase  48.33 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  44.35 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  39.5 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  45.69 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2964  arsenate reductase  46.15 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0847246  normal  0.0110665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2979  arsenate reductase  42.86 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.757259  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  45.54 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  51.55 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  42.28 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  45.76 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  45.16 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  37.82 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  47.52 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  44.35 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  39.5 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  46.39 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  40.87 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  43.43 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>