261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3196 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  100 
 
 
113 aa  229  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1542  arsenate reductase  62.83 
 
 
113 aa  148  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4629  arsenate reductase  61.26 
 
 
120 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12717  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4250  arsenate reductase  61.26 
 
 
120 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4336  arsenate reductase  61.26 
 
 
120 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0780089  normal  0.281607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  57.39 
 
 
115 aa  134  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  53.91 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4784  arsenate reductase  54.87 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.375449  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  52.17 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  53.04 
 
 
140 aa  124  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  53.91 
 
 
140 aa  123  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  51.3 
 
 
140 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  51.3 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  50.89 
 
 
117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  51.3 
 
 
139 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  47.79 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  52.17 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  49.56 
 
 
116 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  51.3 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  51.79 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  49.57 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  46.09 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  48.7 
 
 
140 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  51.75 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  48.67 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  50.45 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  51.75 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  50.88 
 
 
143 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  48.7 
 
 
134 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  48.67 
 
 
116 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2385  putative arsenate reductase  47.41 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  48.7 
 
 
140 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  46.96 
 
 
141 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  47.79 
 
 
113 aa  110  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  49.11 
 
 
142 aa  110  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  49.57 
 
 
117 aa  110  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  42.98 
 
 
116 aa  110  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  47.83 
 
 
141 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  52.17 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  52.17 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  46.43 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  50 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  52.17 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  50 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  47.41 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  48.25 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  49.57 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  50 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3279  arsenate reductase  49.56 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107432  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6300  arsenate reductase  48.25 
 
 
140 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.743402  normal  0.39419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  49.12 
 
 
117 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5710  arsenate reductase  47.37 
 
 
140 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  48.28 
 
 
116 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  47.83 
 
 
141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  46.96 
 
 
141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  48.25 
 
 
116 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  46.96 
 
 
141 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  47.83 
 
 
142 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  46.49 
 
 
116 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4257  arsenate reductase  46.49 
 
 
141 aa  107  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339282 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  46.96 
 
 
143 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  46.49 
 
 
116 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  49.57 
 
 
123 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  48.7 
 
 
141 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  49.12 
 
 
117 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  45.61 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0211  arsenate reductase  45.61 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  45.61 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  45.61 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  45.61 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  45.61 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3705  arsenate reductase  45.61 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.556229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  46.09 
 
 
116 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1942  arsenate reductase  54.95 
 
 
112 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  49.12 
 
 
117 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  48.21 
 
 
116 aa  105  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  48.7 
 
 
118 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  46.09 
 
 
134 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  45.22 
 
 
132 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  48.7 
 
 
118 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3986  arsenate reductase  45.61 
 
 
141 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  48.7 
 
 
118 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  45.61 
 
 
116 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  50 
 
 
144 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.662339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  51.33 
 
 
125 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  46.96 
 
 
140 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  46.96 
 
 
145 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  45.61 
 
 
116 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  47.32 
 
 
140 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  46.85 
 
 
120 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  46.09 
 
 
146 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  47.83 
 
 
138 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  46.09 
 
 
145 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  45.22 
 
 
141 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  47.75 
 
 
116 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  46.09 
 
 
142 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  43.48 
 
 
132 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2534  arsenate reductase  46.96 
 
 
121 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  46.09 
 
 
145 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.335288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>