269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0329 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  100 
 
 
140 aa  285  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  88.57 
 
 
140 aa  258  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  74.82 
 
 
140 aa  222  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  74.29 
 
 
140 aa  221  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  77.37 
 
 
144 aa  217  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.662339 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  76.26 
 
 
140 aa  216  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  74.1 
 
 
140 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  74.45 
 
 
143 aa  213  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  72.66 
 
 
141 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  71.22 
 
 
140 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  71.94 
 
 
141 aa  208  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  74.1 
 
 
142 aa  207  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  70.5 
 
 
141 aa  207  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  70.5 
 
 
145 aa  207  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  70.5 
 
 
141 aa  206  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  68.84 
 
 
140 aa  206  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  71.94 
 
 
145 aa  206  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  72.99 
 
 
145 aa  206  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  67.88 
 
 
140 aa  205  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1283  arsenate reductase  67.39 
 
 
140 aa  205  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.884735  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  71.22 
 
 
141 aa  205  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5710  arsenate reductase  67.15 
 
 
140 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  70.07 
 
 
142 aa  204  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  67.63 
 
 
143 aa  204  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6300  arsenate reductase  67.39 
 
 
140 aa  204  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.743402  normal  0.39419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1910  arsenate reductase  72.66 
 
 
141 aa  203  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1961  arsenate reductase  67.39 
 
 
148 aa  203  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2315  arsenate reductase  66.67 
 
 
140 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509444  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  72.26 
 
 
145 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  71.94 
 
 
141 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  70 
 
 
141 aa  200  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  68.57 
 
 
162 aa  199  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1379  arsenate reductase  71.53 
 
 
145 aa  199  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  67.39 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  67.63 
 
 
141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2288  arsenate reductase  68.84 
 
 
143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  hitchhiker  0.00391371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  66.67 
 
 
143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  65.47 
 
 
141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  69.06 
 
 
141 aa  197  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  69.06 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6564  arsenate reductase  66.42 
 
 
140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  65.22 
 
 
142 aa  194  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  67.14 
 
 
317 aa  193  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2243  arsenate reductase  64.96 
 
 
144 aa  192  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  64.96 
 
 
143 aa  190  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  65.47 
 
 
146 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  64.03 
 
 
142 aa  189  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0718  arsenate reductase  61.87 
 
 
141 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0377236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  72.73 
 
 
139 aa  187  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  62.32 
 
 
141 aa  187  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1214  arsenate reductase  61.87 
 
 
151 aa  187  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3830  arsenate reductase  61.59 
 
 
158 aa  186  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.720829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2345  arsenate reductase  61.59 
 
 
158 aa  186  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  hitchhiker  0.00279499 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  61.15 
 
 
141 aa  185  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0211  arsenate reductase  61.15 
 
 
141 aa  185  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  61.15 
 
 
141 aa  185  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3705  arsenate reductase  61.15 
 
 
141 aa  185  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.556229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  61.15 
 
 
141 aa  185  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  61.15 
 
 
141 aa  185  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3986  arsenate reductase  61.15 
 
 
141 aa  184  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  61.59 
 
 
143 aa  184  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  68.7 
 
 
134 aa  183  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4257  arsenate reductase  61.31 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3795  arsenate reductase  61.59 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.256132 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  66.41 
 
 
138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5671  arsenate reductase  63.5 
 
 
140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229186  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  65.65 
 
 
132 aa  178  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4072  arsenate reductase  69.78 
 
 
141 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124746  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  61.83 
 
 
134 aa  173  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2198  arsenate reductase  61.31 
 
 
137 aa  173  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2389  arsenate reductase  58.27 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  63.36 
 
 
139 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  62.99 
 
 
276 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  61.83 
 
 
137 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0102  arsenate reductase  56.12 
 
 
141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2534  arsenate reductase  63.93 
 
 
121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  60.33 
 
 
132 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  50 
 
 
140 aa  149  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  53.28 
 
 
136 aa  148  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  53.44 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  55.38 
 
 
141 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  50.38 
 
 
152 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0989  arsenate reductase ArsC, putative  56.52 
 
 
115 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1181  arsenate reductase  47.29 
 
 
135 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0957  arsenate reductase  56.52 
 
 
115 aa  134  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3127  putative arsenate reductase  50 
 
 
143 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3857  arsenate reductase  50.75 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4629  arsenate reductase  56.76 
 
 
120 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12717  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4250  arsenate reductase  56.76 
 
 
120 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4336  arsenate reductase  56.76 
 
 
120 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0780089  normal  0.281607 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0605  arsenate reductase and related  48.2 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.756451  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0590  arsenate reductase and related  48.2 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1852  arsenate reductase  49.12 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  51.3 
 
 
113 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4784  arsenate reductase  53.04 
 
 
113 aa  120  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.375449  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  47.83 
 
 
116 aa  120  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1542  arsenate reductase  48.7 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  47.79 
 
 
142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  52.17 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  46.96 
 
 
115 aa  114  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>