268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02143 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  100 
 
 
117 aa  237  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  58.77 
 
 
116 aa  146  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  58.77 
 
 
120 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  59.83 
 
 
117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2385  putative arsenate reductase  59.13 
 
 
116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  56.41 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  56.41 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  56.41 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  58.97 
 
 
116 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  55.56 
 
 
121 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  58.12 
 
 
116 aa  135  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  56.52 
 
 
116 aa  135  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  55.56 
 
 
117 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  53.85 
 
 
117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  54.7 
 
 
117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  52.99 
 
 
117 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  54.7 
 
 
117 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  55.56 
 
 
121 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  56.14 
 
 
119 aa  133  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  56.14 
 
 
119 aa  133  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  56.14 
 
 
119 aa  133  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  56.14 
 
 
119 aa  133  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  56.14 
 
 
119 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  53.85 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  56.14 
 
 
119 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  56.14 
 
 
119 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  57.26 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  55.17 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  57.26 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  58.12 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  56.41 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  56.41 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  55.26 
 
 
119 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  56.41 
 
 
116 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  59.83 
 
 
120 aa  130  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  55.56 
 
 
116 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  59.65 
 
 
120 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  55.56 
 
 
116 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  52.63 
 
 
116 aa  130  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  56.41 
 
 
122 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  58.12 
 
 
116 aa  130  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  52.99 
 
 
117 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  57.14 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  53.91 
 
 
125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  52.63 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  54.7 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  52.63 
 
 
118 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  53.85 
 
 
117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  55.56 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2979  arsenate reductase  54.24 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.757259  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  50.43 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  52.54 
 
 
118 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  51.28 
 
 
116 aa  124  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  52.54 
 
 
119 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  52.54 
 
 
119 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  52.54 
 
 
119 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  52.54 
 
 
119 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  52.54 
 
 
119 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  54.39 
 
 
117 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2484  arsenate reductase  51.22 
 
 
123 aa  120  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  48.7 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  54.24 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2408  arsenate reductase  53.98 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00110254  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1142  arsenate reductase  53.98 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2113  arsenate reductase  53.98 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0142816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1421  arsenate reductase  53.98 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245055  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  52.14 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  53.1 
 
 
118 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1002  arsenate reductase  49.12 
 
 
116 aa  114  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.540105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  53.1 
 
 
118 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  53.1 
 
 
118 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2370  arsenate reductase  52.21 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000151133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2883  arsenate reductase  52.94 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3564  arsenate reductase  49.57 
 
 
125 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  49.57 
 
 
113 aa  110  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3191  arsenate reductase  49.15 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2887  arsenate reductase  50 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  48.67 
 
 
114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  44.83 
 
 
142 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0915  arsenate reductase  45.22 
 
 
125 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.435432 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0826  arsenate reductase  44.83 
 
 
125 aa  103  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295168  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1073  arsenate reductase  49.58 
 
 
118 aa  103  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0830034  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3271  arsenate reductase  49.15 
 
 
119 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  47.86 
 
 
115 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1881  arsenate reductase  49.12 
 
 
113 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0302  hypothetical protein  46.15 
 
 
113 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  44.44 
 
 
143 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  44.74 
 
 
140 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1896  arsenate reductase  44.44 
 
 
115 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3436  arsenate reductase  45.76 
 
 
119 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0318  hypothetical protein  44.44 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3030  arsenate reductase  44.92 
 
 
119 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26931  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  44.74 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  41.03 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  40 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  41.74 
 
 
141 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  42.61 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  47.9 
 
 
117 aa  99  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  46.9 
 
 
119 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4964  arsenate reductase  48.67 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000180468  normal  0.016428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>