255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1914 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  100 
 
 		 116 aa  227  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  69.83 
 
 		 116 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  70.69 
 
 		 116 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  70.69 
 
 		 116 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  70.69 
 
 		 116 aa  163  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  68.97 
 
 		 116 aa  158  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  67.24 
 
 		 122 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  67.24 
 
 		 116 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  67.24 
 
 		 116 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  66.38 
 
 		 116 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  66.38 
 
 		 116 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  64.86 
 
 		 117 aa  147  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  67.57 
 
 		 120 aa  147  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  62.07 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  66.07 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  65.52 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  59.48 
 
 		 118 aa  143  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  61.26 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  62.07 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  60.34 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  62.5 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  62.93 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  59.48 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  62.93 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  62.93 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  62.93 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  62.93 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  62.93 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  62.93 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  59.46 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  58.62 
 
 		 116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  60.71 
 
 		 120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  62.07 
 
 		 119 aa  133  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  60.34 
 
 		 116 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  56.41 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  56.41 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  56.41 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  56.9 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  56.9 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2979  arsenate reductase  60.71 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.757259  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  58.97 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  59.82 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  59.82 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  59.82 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  59.82 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  57.89 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  59.82 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  56.03 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  57.02 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  58.62 
 
 		 116 aa  123  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2385  putative arsenate reductase  54.39 
 
 		 116 aa  123  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  52.59 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  53.45 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  53.45 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  54.7 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  53.1 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  49.14 
 
 		 117 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  50.86 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  50.86 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  51.85 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  52.14 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  51.72 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  53.1 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2484  arsenate reductase  50.41 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  48.65 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2883  arsenate reductase  50.88 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1073  arsenate reductase  52.94 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0830034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3271  arsenate reductase  49.57 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  46.49 
 
 		 115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0826  arsenate reductase  50 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3436  arsenate reductase  47.83 
 
 		 119 aa  105  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1002  arsenate reductase  50 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.540105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  48.21 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  47.32 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  45.13 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  44.25 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  43.36 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  49.12 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  49.12 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  49.12 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3191  arsenate reductase  50.43 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  44.83 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  47.27 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  44.83 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  46.55 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  46.3 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  45.13 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  43.75 
 
 		 317 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  46.85 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  44.74 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4964  arsenate reductase  48.18 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000180468  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3564  arsenate reductase  46.85 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2887  arsenate reductase  46.85 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1207  arsenate reductase  45.38 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0485928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  44.14 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0302  hypothetical protein  44.83 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4544  arsenate reductase  49.09 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  44.74 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1421  arsenate reductase  48.25 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245055  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1142  arsenate reductase  48.25 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>