297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1355 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  100 
 
 
118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  100 
 
 
118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  100 
 
 
118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  76.92 
 
 
117 aa  188  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  70.43 
 
 
123 aa  173  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  70.69 
 
 
125 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  67.24 
 
 
118 aa  168  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  67.24 
 
 
119 aa  166  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  67.24 
 
 
119 aa  166  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  67.24 
 
 
119 aa  166  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  67.24 
 
 
119 aa  166  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  67.24 
 
 
119 aa  166  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  68.7 
 
 
116 aa  166  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  67.24 
 
 
119 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  66.38 
 
 
119 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  66.96 
 
 
120 aa  164  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  66.38 
 
 
119 aa  164  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2979  arsenate reductase  67.54 
 
 
119 aa  160  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.757259  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2385  putative arsenate reductase  63.48 
 
 
116 aa  160  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  64.35 
 
 
116 aa  159  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  64.66 
 
 
118 aa  157  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  62.28 
 
 
119 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  62.28 
 
 
119 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  62.28 
 
 
119 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  62.28 
 
 
119 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  62.28 
 
 
119 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  60.68 
 
 
117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  62.39 
 
 
116 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  60.68 
 
 
117 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  63.39 
 
 
120 aa  144  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  59.83 
 
 
117 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  61.54 
 
 
121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  61.54 
 
 
117 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  61.54 
 
 
117 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  59.83 
 
 
121 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  58.97 
 
 
116 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  60.68 
 
 
116 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  60.68 
 
 
116 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  61.54 
 
 
117 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  59.83 
 
 
116 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  59.83 
 
 
116 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  58.12 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  58.97 
 
 
117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  61.4 
 
 
120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  56.41 
 
 
117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  61.21 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  57.26 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  59.83 
 
 
122 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  58.97 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  59.83 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1073  arsenate reductase  57.98 
 
 
118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0830034  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1002  arsenate reductase  59.65 
 
 
116 aa  134  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.540105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  58.97 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0826  arsenate reductase  55.86 
 
 
125 aa  131  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295168  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  56.41 
 
 
116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  57.26 
 
 
116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  58.26 
 
 
116 aa  130  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  55.08 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  56.41 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  57.63 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  56.25 
 
 
117 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  54.7 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3271  arsenate reductase  55.08 
 
 
119 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  51.69 
 
 
117 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2484  arsenate reductase  52.03 
 
 
123 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  53.04 
 
 
114 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  56.41 
 
 
116 aa  120  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  52.99 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3436  arsenate reductase  53.39 
 
 
119 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  52.17 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  53.98 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  48.72 
 
 
142 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1207  arsenate reductase  51.67 
 
 
117 aa  113  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0485928  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4544  arsenate reductase  54.87 
 
 
119 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001485  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5167  arsenate reductase  53.98 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000109788  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4964  arsenate reductase  53.98 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000180468  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5692  arsenate reductase  53.98 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000484398  hitchhiker  0.00107308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  50.43 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  48.67 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  48.72 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  52.54 
 
 
118 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  52.54 
 
 
118 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  52.54 
 
 
118 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  46.9 
 
 
134 aa  110  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  49.57 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  47.83 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  52.17 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  49.57 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0302  hypothetical protein  47.01 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1852  arsenate reductase  48.25 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2883  arsenate reductase  49.59 
 
 
117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3564  arsenate reductase  49.14 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  49.57 
 
 
142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4336  arsenate reductase  50 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0780089  normal  0.281607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2964  arsenate reductase  48.25 
 
 
115 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0847246  normal  0.0110665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4250  arsenate reductase  50 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4629  arsenate reductase  50 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12717  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1181  arsenate reductase  44.44 
 
 
135 aa  107  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0957  arsenate reductase  47.83 
 
 
115 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  46.96 
 
 
142 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>