294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2871 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  100 
 
 		 122 aa  247  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  84.48 
 
 		 116 aa  201  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  85.34 
 
 		 116 aa  200  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  84.48 
 
 		 116 aa  199  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  78.45 
 
 		 116 aa  185  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  78.45 
 
 		 116 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  78.45 
 
 		 116 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  77.59 
 
 		 116 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  77.59 
 
 		 116 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  67.24 
 
 		 116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  68.1 
 
 		 116 aa  161  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  71.17 
 
 		 120 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  66.95 
 
 		 120 aa  156  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  67.24 
 
 		 116 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  66.38 
 
 		 116 aa  154  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  66.38 
 
 		 116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  62.6 
 
 		 123 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  59.83 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  58.62 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  60.16 
 
 		 125 aa  140  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  60.34 
 
 		 116 aa  140  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  61.54 
 
 		 117 aa  140  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  54.31 
 
 		 117 aa  139  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  58.62 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  58.62 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  56.9 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  59.29 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  58.62 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  61.4 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  55.17 
 
 		 117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  59.66 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  59.83 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  59.83 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  59.83 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  61.86 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  61.54 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  54.31 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  61.02 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  61.02 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  61.02 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  54.31 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  61.02 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  61.02 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0443619 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  61.02 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  57.76 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2979  arsenate reductase  57.89 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.757259  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  55.36 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  59.32 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  56.41 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  59.65 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  55.17 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  59.65 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  59.65 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  59.65 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  59.65 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  55.26 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  57.89 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  56.64 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  52.63 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  50 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2385  putative arsenate reductase  54.39 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3271  arsenate reductase  49.57 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1073  arsenate reductase  53.78 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0830034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  54.39 
 
 		 116 aa  117  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  45.61 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  47.79 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2883  arsenate reductase  51.69 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3436  arsenate reductase  47.86 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2484  arsenate reductase  52.03 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  53.57 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3191  arsenate reductase  52.99 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  49.56 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  47.75 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  46.43 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  46.55 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  47.75 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1207  arsenate reductase  47.86 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0485928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  46.55 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0826  arsenate reductase  43.97 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1002  arsenate reductase  51.75 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.540105  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  46.02 
 
 		 141 aa  105  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  48.28 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  48.28 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  48.28 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  42.74 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  44.25 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  45.69 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  43.97 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  46.9 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  46.43 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  43.97 
 
 		 143 aa  103  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1881  arsenate reductase  46.02 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  42.62 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  44.25 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2964  arsenate reductase  46.9 
 
 		 115 aa  103  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0847246  normal  0.0110665 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1181  arsenate reductase  42.24 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3564  arsenate reductase  44.26 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  43.36 
 
 		 317 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2887  arsenate reductase  45.3 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  45.13 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>