More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0900 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  100 
 
 		 117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  64.6 
 
 		 121 aa  153  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  64.04 
 
 		 116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  62.83 
 
 		 117 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  61.95 
 
 		 117 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  64.66 
 
 		 117 aa  147  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  62.83 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  60.17 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  61.95 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  61.06 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  60.18 
 
 		 117 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  62.28 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  62.28 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  62.28 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  62.28 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  60.18 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  62.28 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  62.28 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  62.28 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  61.4 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  59.65 
 
 		 116 aa  140  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  57.52 
 
 		 117 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  57.63 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  60.18 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  57.52 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  61.21 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  61.21 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  61.21 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  54.7 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  59.46 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  58.56 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  59.13 
 
 		 116 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  56.52 
 
 		 125 aa  133  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  59.46 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2979  arsenate reductase  55.93 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.757259  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  55.08 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  55.08 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  55.08 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  55.65 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  55.08 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  58.12 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  55.08 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  56.41 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  56.41 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  55.56 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  57.14 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  55.56 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  55.56 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2385  putative arsenate reductase  56.52 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  57.14 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  54.78 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  54.31 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  56.64 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  54.31 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  54.31 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  57.52 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2964  arsenate reductase  51.28 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0847246  normal  0.0110665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  52.99 
 
 		 116 aa  123  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  54.39 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  53.57 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  53.1 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5167  arsenate reductase  54.31 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000109788  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4544  arsenate reductase  56.03 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5692  arsenate reductase  54.31 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000484398  hitchhiker  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  53.1 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  53.1 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  52.99 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4964  arsenate reductase  55.17 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000180468  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  54.7 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  52.99 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2408  arsenate reductase  53.45 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00110254  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1142  arsenate reductase  53.45 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2113  arsenate reductase  53.45 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0142816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1421  arsenate reductase  53.45 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245055  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  53.45 
 
 		 119 aa  120  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2370  arsenate reductase  53.45 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000151133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  52.21 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  50.89 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2883  arsenate reductase  52.54 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0006  arsenate reductase  54.31 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000819049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  53.1 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  53.1 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3436  arsenate reductase  50.43 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  50.44 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4150  arsenate reductase  50.85 
 
 		 123 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  50.44 
 
 		 116 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  50 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3271  putative arsenate reductase oxidoreductase protein  50.43 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  51.33 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  47.79 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  49.56 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3986  arsenate reductase  51.33 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4784  arsenate reductase  50.88 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.375449  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  51.33 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0211  arsenate reductase  51.33 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  51.33 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  51.33 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  51.33 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1207  arsenate reductase  50 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0485928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3705  arsenate reductase  51.33 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.556229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>