284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4964 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4964  arsenate reductase  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000180468  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  94.96 
 
 		 119 aa  230  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4544  arsenate reductase  89.08 
 
 		 119 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5167  arsenate reductase  87.39 
 
 		 119 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000109788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5692  arsenate reductase  87.39 
 
 		 119 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000484398  hitchhiker  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3163  arsenate reductase  89.08 
 
 		 119 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000451788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0006  arsenate reductase  89.08 
 
 		 119 aa  201  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000819049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  74.58 
 
 		 118 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  74.58 
 
 		 118 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  74.58 
 
 		 118 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2408  arsenate reductase  73.73 
 
 		 118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00110254  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2113  arsenate reductase  73.73 
 
 		 118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0142816  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1142  arsenate reductase  73.73 
 
 		 118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1421  arsenate reductase  73.73 
 
 		 118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245055  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2370  arsenate reductase  69.49 
 
 		 118 aa  173  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000151133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3436  arsenate reductase  65.25 
 
 		 119 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4150  arsenate reductase  60.17 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3271  arsenate reductase  61.86 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3030  arsenate reductase  56.78 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7012  arsenate reductase  56.78 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132102  hitchhiker  0.00599586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  55.08 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  55.17 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3271  putative arsenate reductase oxidoreductase protein  51.69 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  52.63 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  52.17 
 
 		 116 aa  117  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  53.04 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  49.57 
 
 		 116 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03194  hypothetical protein  51.3 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  51.72 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  53.98 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  53.98 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  53.98 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  53.98 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  50.86 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  49.57 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  49.57 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2385  putative arsenate reductase  47.83 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  49.57 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  49.57 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  50.86 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  51.35 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  50 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  53.57 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  51.79 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  50 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  50.89 
 
 		 117 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0302  hypothetical protein  50.85 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  48.28 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  50.89 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  48.31 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  47.41 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3141  arsenate reductase  45.76 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3469  arsenate reductase and related  45.76 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  49.11 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  48.67 
 
 		 118 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0318  hypothetical protein  49.15 
 
 		 113 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  49.56 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  47.32 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  49.56 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  47.32 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  49.11 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  48.21 
 
 		 117 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  44.35 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  47.86 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  44.35 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  46.22 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  47.79 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  44.35 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  45.76 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  46.55 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  48.18 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  48.67 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  48.67 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  47.75 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  48.67 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1073  arsenate reductase  46.15 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0830034  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  43.1 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  44.83 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  44.83 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  44.35 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1002  arsenate reductase  47.83 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.540105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  48.67 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  46.55 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  48.25 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2979  arsenate reductase  45.3 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.757259  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2887  arsenate reductase  50 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  44.92 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3564  arsenate reductase  49.14 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  44.83 
 
 		 276 aa  93.6  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  46.43 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>