257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1961 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1961  arsenate reductase  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  80.29 
 
 		 140 aa  233  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  78.99 
 
 		 140 aa  228  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5710  arsenate reductase  78.1 
 
 		 140 aa  225  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6300  arsenate reductase  78.26 
 
 		 140 aa  224  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.743402  normal  0.39419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  76.81 
 
 		 140 aa  224  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1283  arsenate reductase  73.91 
 
 		 140 aa  219  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.884735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2315  arsenate reductase  73.91 
 
 		 140 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5671  arsenate reductase  75.36 
 
 		 140 aa  218  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6564  arsenate reductase  75.36 
 
 		 140 aa  214  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  73.19 
 
 		 143 aa  210  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0718  arsenate reductase  69.78 
 
 		 141 aa  206  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0377236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2288  arsenate reductase  73.91 
 
 		 143 aa  206  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  hitchhiker  0.00391371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  68.61 
 
 		 143 aa  204  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3830  arsenate reductase  65.73 
 
 		 158 aa  203  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.720829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2345  arsenate reductase  65.73 
 
 		 158 aa  203  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  hitchhiker  0.00279499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  67.39 
 
 		 140 aa  203  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  72.26 
 
 		 144 aa  203  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.662339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  66.91 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0211  arsenate reductase  66.91 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  66.91 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3986  arsenate reductase  66.91 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  66.91 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  66.91 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  75.19 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3705  arsenate reductase  66.91 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.556229  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  68.12 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  67.88 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  69.57 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  66.91 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1214  arsenate reductase  67.14 
 
 		 151 aa  201  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  68.84 
 
 		 140 aa  200  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  69.57 
 
 		 140 aa  200  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  69.57 
 
 		 140 aa  199  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  67.38 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4257  arsenate reductase  66.67 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.339282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  67.86 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2243  arsenate reductase  65 
 
 		 144 aa  198  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  69.29 
 
 		 145 aa  197  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  69.34 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  67.15 
 
 		 141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  65.69 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  66.43 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  68.79 
 
 		 141 aa  197  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  67.86 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3795  arsenate reductase  65.47 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256132 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  68.61 
 
 		 143 aa  196  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  67.15 
 
 		 317 aa  196  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  68.79 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  64.29 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  66.67 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  65 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  69.34 
 
 		 145 aa  194  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  66.43 
 
 		 145 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  66.43 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  67.67 
 
 		 134 aa  191  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  65 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2198  arsenate reductase  69.85 
 
 		 137 aa  190  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  65.96 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  64.03 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2389  arsenate reductase  62.59 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  65.44 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1379  arsenate reductase  65.71 
 
 		 145 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  70.77 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  63.5 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1910  arsenate reductase  65 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  69.23 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  61.81 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  71.32 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  68.46 
 
 		 132 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  59.31 
 
 		 162 aa  180  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  64.89 
 
 		 276 aa  176  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4072  arsenate reductase  68.57 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124746  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0102  arsenate reductase  59.29 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  59.4 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  63.78 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  65.12 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2534  arsenate reductase  65 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  62.5 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  57.89 
 
 		 152 aa  156  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  61.54 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_004310  BR0989  arsenate reductase ArsC, putative  62.83 
 
 		 115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0957  arsenate reductase  62.83 
 
 		 115 aa  149  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1852  arsenate reductase  58.26 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1181  arsenate reductase  52.71 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3127  putative arsenate reductase  53.28 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0605  arsenate reductase and related  51.82 
 
 		 140 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.756451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  46.67 
 
 		 140 aa  130  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3857  arsenate reductase  54.01 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0590  arsenate reductase and related  51.82 
 
 		 140 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  57.52 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  50.88 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  55.26 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  50 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4629  arsenate reductase  49.18 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12717  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4250  arsenate reductase  49.18 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4336  arsenate reductase  49.18 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0780089  normal  0.281607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  48.25 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  50.43 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0915  arsenate reductase  47.86 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>