More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0484 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0484  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  243  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0831  hypothetical protein  74.36 
 
 
118 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0222832  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0848  hypothetical protein  74.36 
 
 
118 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000170157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0104  hypothetical protein  50.43 
 
 
121 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000725895  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5136  hypothetical protein  50.43 
 
 
121 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00116769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4815  arsenate reductase and related  50.43 
 
 
121 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000608235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5098  hypothetical protein  50.43 
 
 
121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5131  hypothetical protein  50.43 
 
 
121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000307731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4860  hypothetical protein  50.43 
 
 
121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00587583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4701  arsenate reductase  50.43 
 
 
121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000403452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4717  arsenate reductase  50.43 
 
 
121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000794506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5134  hypothetical protein  50.43 
 
 
121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5229  hypothetical protein  50.43 
 
 
121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000111635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3587  arsenate reductase and related  50.43 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000181597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2672  ArsC family protein  51.35 
 
 
118 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3085  arsenate reductase and related protein  48.21 
 
 
121 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1227  arsenate reductase-like protein  52.63 
 
 
116 aa  123  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0377226  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2357  ArsC family protein  50.45 
 
 
118 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0237  arsenate reductase and related  46.36 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.323435 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10960  hypothetical protein  45.95 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.262634  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0206  arsenate reductase and related  46.09 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2934  arsenate reductase and related  50 
 
 
120 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0130498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1508  hypothetical protein  49.09 
 
 
118 aa  114  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1109  arsenate reductase and related  48.21 
 
 
122 aa  111  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0838  arsenate reductase  44.74 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0227147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5135  arsenate reductase related protein  42.11 
 
 
134 aa  110  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0920  arsenate reductase-like protein  49.55 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15090  hypothetical protein  43.75 
 
 
119 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.737886  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2504  arsenate reductase and related  43.59 
 
 
120 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2269  arsenate reductase and related  42.98 
 
 
118 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.81941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1564  hypothetical protein  44.95 
 
 
118 aa  102  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1485  arsenate reductase  41.28 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000184523  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1058  arsenate reductase and related  50 
 
 
116 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0744  arsenate reductase  39.83 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000148038  hitchhiker  0.000145224 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05761  putative arsenate reductase  40.35 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2009  arsenate reductase and related  39.82 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000123591  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07481  putative arsenate reductase  40.17 
 
 
120 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2269  arsenate reductase and related  38.46 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05691  putative arsenate reductase  40.17 
 
 
118 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0513  hypothetical protein  39.32 
 
 
118 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.752698  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05131  putative arsenate reductase  38.94 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129229  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05391  putative arsenate reductase  38.46 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2687  hypothetical protein  38.53 
 
 
117 aa  76.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0697  hypothetical protein  37.72 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1661  hypothetical protein  34.82 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1845  hypothetical protein  32.48 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.404763  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05701  putative arsenate reductase  33.33 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1028  arsenate reductase and related  31.58 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1359  arsenate reductase  27.19 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00176431  normal  0.0126888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1618  transcriptional regulator Spx  27.19 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0736  arsenate reductase and related  29.73 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.127695 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0763  transcriptional regulator Spx  27.19 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0567  arsenate reductase and related  27.19 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0545  arsenate reductase  28.32 
 
 
128 aa  60.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3411  transcriptional regulator Spx  26.55 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000835539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1835  transcriptional regulator Spx  26.55 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.27338  normal  0.376442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01143  ArsC family protein  31.03 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.013195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0576  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.926413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3423  transcriptional regulator Spx  25.66 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126084  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0996  transcriptional regulator Spx  25.66 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00113345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  26.21 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1015  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000679905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0996  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.444698  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2092  transcriptional regulator Spx  27.43 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00819419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3202  transcriptional regulator Spx  24.78 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0489409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3181  transcriptional regulator Spx  24.78 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3109  transcriptional regulator Spx  24.78 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3422  transcriptional regulator Spx  24.78 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3456  transcriptional regulator Spx  24.78 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  28.95 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  30.36 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3434  transcriptional regulator Spx  24.78 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1309  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1109  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1091  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1085  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1242  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1270  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1200  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4100  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0904  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.873656  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0078  transcriptional regulator Spx  27.43 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1347  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0109883  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0911  arsenate reductase  25.23 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0335675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1097  transcriptional regulator Spx  25.44 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4336  arsenate reductase  26.04 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0780089  normal  0.281607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4629  arsenate reductase  26.04 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12717  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4250  arsenate reductase  26.04 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  28.7 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  28.7 
 
 
118 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  28.7 
 
 
118 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  23.81 
 
 
117 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  30.28 
 
 
121 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  27.43 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1290  hypothetical protein  27.83 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1087  arsenate reductase and related  25.22 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.95059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  30.28 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  28.7 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1157  arsenate reductase  28.18 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.626027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  24.04 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.739002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>