265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1109 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1109  arsenate reductase and related  100 
 
 
122 aa  253  6e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2504  arsenate reductase and related  61.48 
 
 
120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15090  hypothetical protein  58.47 
 
 
119 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.737886  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1508  hypothetical protein  50.44 
 
 
118 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2269  arsenate reductase and related  53.51 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.81941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10960  hypothetical protein  48.28 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.262634  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0206  arsenate reductase and related  49.12 
 
 
125 aa  122  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0237  arsenate reductase and related  51.75 
 
 
119 aa  122  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.323435 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2357  ArsC family protein  46.96 
 
 
118 aa  120  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2672  ArsC family protein  46.96 
 
 
118 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1058  arsenate reductase and related  49.57 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0484  hypothetical protein  48.21 
 
 
117 aa  111  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3085  arsenate reductase and related protein  46.3 
 
 
121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1227  arsenate reductase-like protein  45.61 
 
 
116 aa  107  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0377226  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0838  arsenate reductase  44.55 
 
 
116 aa  106  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0227147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5135  arsenate reductase related protein  40.17 
 
 
134 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0831  hypothetical protein  47.32 
 
 
118 aa  103  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0222832  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0848  hypothetical protein  47.32 
 
 
118 aa  103  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000170157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4815  arsenate reductase and related  41.59 
 
 
121 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000608235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5131  hypothetical protein  41.59 
 
 
121 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000307731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4860  hypothetical protein  41.59 
 
 
121 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00587583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4701  arsenate reductase  41.59 
 
 
121 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000403452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3587  arsenate reductase and related  41.59 
 
 
121 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000181597  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4717  arsenate reductase  41.59 
 
 
121 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000794506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5136  hypothetical protein  41.59 
 
 
121 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00116769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5098  hypothetical protein  41.59 
 
 
121 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5229  hypothetical protein  41.59 
 
 
121 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000111635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0104  hypothetical protein  41.59 
 
 
121 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000725895  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5134  hypothetical protein  41.59 
 
 
121 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2934  arsenate reductase and related  43.12 
 
 
120 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0130498  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0744  arsenate reductase  43.36 
 
 
118 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000148038  hitchhiker  0.000145224 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0920  arsenate reductase-like protein  41.67 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07481  putative arsenate reductase  42.5 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2009  arsenate reductase and related  38.39 
 
 
120 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000123591  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2269  arsenate reductase and related  36.04 
 
 
122 aa  84.3  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0697  hypothetical protein  40.52 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1564  hypothetical protein  42.31 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1661  hypothetical protein  38.79 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05701  putative arsenate reductase  37.19 
 
 
126 aa  77  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1485  arsenate reductase  35.58 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000184523  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1845  hypothetical protein  37.61 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.404763  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05131  putative arsenate reductase  40.35 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129229  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  72  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  33.03 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05761  putative arsenate reductase  31.62 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  33.33 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  29.91 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  30.56 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0513  hypothetical protein  33.06 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.752698  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  32.41 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  31.48 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  29.06 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05691  putative arsenate reductase  30.83 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  31.58 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05391  putative arsenate reductase  31.3 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  34.55 
 
 
115 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  30.08 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  25.44 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0736  arsenate reductase and related  37.38 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.127695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1277  arsenate reductase and related  36.45 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300917  normal  0.698716 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  62  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  26.45 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  30.08 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  32.41 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1028  arsenate reductase and related  31.3 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  29.06 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  32.41 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  30.56 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  25.62 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2687  hypothetical protein  35.14 
 
 
117 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  29.06 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  32.41 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  30.56 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  32.32 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  29.63 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01143  ArsC family protein  32.41 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.013195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  29.06 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  24.79 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  32.41 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1087  arsenate reductase and related  30.36 
 
 
114 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.95059 
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  26.32 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  31.25 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  31.31 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  27.78 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  26.32 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  27.62 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  25.93 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  32.41 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  32.41 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  27.45 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  32.41 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  30.97 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  31.31 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  25.64 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  26.85 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  31.48 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  30.08 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  26.85 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  28.57 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1859  arsenate reductase  32 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.983128  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>