57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1650 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1650  nitrogenase-associated protein  100 
 
 
150 aa  314  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2105  nitrogenase-associated protein  60 
 
 
150 aa  203  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.980388  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0911  nitrogenase-associated protein  61.38 
 
 
148 aa  199  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1555  nitrogenase-associated protein  51.03 
 
 
137 aa  146  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.65637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3773  nitrogenase-associated protein  45 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1007  nitrogenase-associated protein  50.43 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4806  nitrogenase-associated protein  41.43 
 
 
141 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2504  nitrogenase-associated protein  47.41 
 
 
137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2631  nitrogenase-associated protein  40.71 
 
 
157 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4315  nitrogenase-associated protein  50.85 
 
 
145 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00428414  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0511  nitrogenase-associated protein  46.55 
 
 
149 aa  120  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0223  nitrogenase-associated protein  47.41 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1764  nitrogenase-associated protein  50.42 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1800  nitrogenase-associated protein  41.01 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.663505  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1192  nitrogenase-associated protein  44.36 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1772  nitrogenase-associated protein  41.01 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1186  nitrogenase-associated protein  46.61 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1840  nitrogenase-associated protein  39.33 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1208  nitrogenase-associated protein  40.58 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5881  putative arsenate reductase (nitrogenase-associated protein)  49.06 
 
 
139 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0819125  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1054  nitrogenase-associated protein  45.76 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0471  nitrogenase-associated protein  45.13 
 
 
141 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  47.32 
 
 
462 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0427  nitrogenase-associated protein  43.97 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0451  nitrogenase-associated protein  39.86 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  47.32 
 
 
462 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51030  nitrogenase-associated protein  45.37 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0511057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0145  nitrogenase-associated protein  49.06 
 
 
143 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776739  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29330  hypothetical protein  41.32 
 
 
142 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1460  nitrogenase-associated protein  39.2 
 
 
161 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1452  nitrogenase-associated protein  44.26 
 
 
159 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2351  nitrogenase-associated protein  45.76 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1060  nitrogenase-associated protein  37.74 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.0000873052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3085  arsenate reductase and related protein  30.84 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  27.12 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  30.21 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  32.05 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  30.39 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  29.47 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  28.83 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  28.83 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  28.83 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1181  arsenate reductase  28.87 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  27.93 
 
 
121 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  30.85 
 
 
134 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  26.67 
 
 
142 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  30.85 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  25.74 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  25.44 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1961  arsenate reductase  29.13 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  27.08 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  27.27 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  27.62 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  29.03 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  27.27 
 
 
114 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1881  arsenate reductase  24.11 
 
 
113 aa  40  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  25 
 
 
113 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>