51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1186 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1186  nitrogenase-associated protein  100 
 
 		 130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1054  nitrogenase-associated protein  84.5 
 
 		 130 aa  235  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1192  nitrogenase-associated protein  76.15 
 
 		 131 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4315  nitrogenase-associated protein  68.46 
 
 		 145 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00428414  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1840  nitrogenase-associated protein  56 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2504  nitrogenase-associated protein  62.39 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1208  nitrogenase-associated protein  58.27 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3773  nitrogenase-associated protein  57.76 
 
 		 144 aa  153  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2631  nitrogenase-associated protein  54.17 
 
 		 157 aa  151  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1800  nitrogenase-associated protein  52 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.663505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1772  nitrogenase-associated protein  52 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0511  nitrogenase-associated protein  58.97 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4806  nitrogenase-associated protein  55.08 
 
 		 141 aa  147  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1007  nitrogenase-associated protein  56.9 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353032  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0471  nitrogenase-associated protein  54.78 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1764  nitrogenase-associated protein  55.37 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0451  nitrogenase-associated protein  56.67 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0223  nitrogenase-associated protein  56.9 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  56.76 
 
 		 462 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  56.76 
 
 		 462 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0145  nitrogenase-associated protein  53.91 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51030  nitrogenase-associated protein  56.31 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0511057  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1555  nitrogenase-associated protein  49.14 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.65637  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2105  nitrogenase-associated protein  47.46 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.980388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0427  nitrogenase-associated protein  44.83 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5881  putative arsenate reductase (nitrogenase-associated protein)  53.64 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0819125  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1460  nitrogenase-associated protein  54.31 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556054 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1650  nitrogenase-associated protein  46.61 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1452  nitrogenase-associated protein  49.18 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29330  hypothetical protein  48.65 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2351  nitrogenase-associated protein  50.81 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0911  nitrogenase-associated protein  43.97 
 
 		 148 aa  105  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1060  nitrogenase-associated protein  46.23 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.0000873052 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  30.21 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2271  arsenate reductase  26.09 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3423  transcriptional regulator Spx  25.47 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2504  arsenate reductase and related  26.55 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3202  transcriptional regulator Spx  25.71 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0489409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3181  transcriptional regulator Spx  25.71 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3422  transcriptional regulator Spx  25.71 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3109  transcriptional regulator Spx  25.71 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3456  transcriptional regulator Spx  25.71 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3411  transcriptional regulator Spx  25 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000835539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3434  transcriptional regulator Spx  25.71 
 
 		 131 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1157  arsenate reductase and related  27.88 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.994579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0996  transcriptional regulator Spx  24.35 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00113345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  28.87 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  52.94 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1835  transcriptional regulator Spx  25.23 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.27338  normal  0.376442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  25.44 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3085  arsenate reductase and related protein  25.22 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>