78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1208 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1208  nitrogenase-associated protein  100 
 
 
146 aa  303  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1186  nitrogenase-associated protein  58.27 
 
 
130 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1800  nitrogenase-associated protein  50.74 
 
 
133 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.663505  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1772  nitrogenase-associated protein  50.74 
 
 
133 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0471  nitrogenase-associated protein  49.64 
 
 
141 aa  152  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1840  nitrogenase-associated protein  51.08 
 
 
148 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1764  nitrogenase-associated protein  53.79 
 
 
141 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1054  nitrogenase-associated protein  54.33 
 
 
130 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3773  nitrogenase-associated protein  50.7 
 
 
144 aa  148  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4315  nitrogenase-associated protein  57.26 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00428414  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0223  nitrogenase-associated protein  50.74 
 
 
145 aa  143  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1192  nitrogenase-associated protein  52.27 
 
 
131 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  48.92 
 
 
462 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  48.92 
 
 
462 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4806  nitrogenase-associated protein  47.14 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2631  nitrogenase-associated protein  49.65 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1007  nitrogenase-associated protein  46.53 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0511  nitrogenase-associated protein  49.62 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2504  nitrogenase-associated protein  52.99 
 
 
137 aa  133  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1460  nitrogenase-associated protein  48.2 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51030  nitrogenase-associated protein  57.28 
 
 
147 aa  130  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0511057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0427  nitrogenase-associated protein  45.77 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2105  nitrogenase-associated protein  48.55 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.980388  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1555  nitrogenase-associated protein  43.66 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.65637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0451  nitrogenase-associated protein  55.56 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0145  nitrogenase-associated protein  48.12 
 
 
143 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776739  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1452  nitrogenase-associated protein  48.92 
 
 
159 aa  120  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2351  nitrogenase-associated protein  49.22 
 
 
142 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5881  putative arsenate reductase (nitrogenase-associated protein)  48.18 
 
 
139 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0819125  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1650  nitrogenase-associated protein  40.58 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0911  nitrogenase-associated protein  44.17 
 
 
148 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1060  nitrogenase-associated protein  39.05 
 
 
132 aa  94  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.0000873052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29330  hypothetical protein  42.72 
 
 
142 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  26.79 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  27.59 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  27.59 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  27.59 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  27.59 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  27.59 
 
 
119 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  27.59 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  27.59 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  28.57 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  27.59 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  26.79 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2883  arsenate reductase  30.28 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  26.79 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2271  arsenate reductase  29 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  30.7 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  25.89 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0237  arsenate reductase and related  28.83 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.323435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  27.68 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  25.89 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  26.79 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  27.43 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5135  arsenate reductase related protein  28.21 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  27.68 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  25 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15090  hypothetical protein  24.32 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.737886  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  27.68 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  26.09 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  26.09 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  26.09 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  26.09 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  26.09 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  27.45 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  24.56 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  24.56 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  25.47 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2269  arsenate reductase and related  27.19 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.81941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  25.89 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  24.11 
 
 
117 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  27.1 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  26.79 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  27.27 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2370  arsenate reductase  25.66 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000151133  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  26 
 
 
140 aa  40  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  31 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  25 
 
 
116 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>