91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0223 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0223  nitrogenase-associated protein  100 
 
 
145 aa  295  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3773  nitrogenase-associated protein  61.72 
 
 
144 aa  178  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1764  nitrogenase-associated protein  63.64 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2631  nitrogenase-associated protein  67.24 
 
 
157 aa  169  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1800  nitrogenase-associated protein  55.22 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.663505  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1772  nitrogenase-associated protein  55.22 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0471  nitrogenase-associated protein  55 
 
 
141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4806  nitrogenase-associated protein  63.25 
 
 
141 aa  156  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1840  nitrogenase-associated protein  54.55 
 
 
148 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  55.4 
 
 
462 aa  153  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  55.4 
 
 
462 aa  153  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0511  nitrogenase-associated protein  55.88 
 
 
149 aa  153  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1192  nitrogenase-associated protein  61.21 
 
 
131 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4315  nitrogenase-associated protein  58.62 
 
 
145 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00428414  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0451  nitrogenase-associated protein  62.93 
 
 
171 aa  148  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1054  nitrogenase-associated protein  60.34 
 
 
130 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2504  nitrogenase-associated protein  54.41 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1007  nitrogenase-associated protein  58.62 
 
 
143 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1208  nitrogenase-associated protein  50.74 
 
 
146 aa  143  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0427  nitrogenase-associated protein  51.11 
 
 
143 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1186  nitrogenase-associated protein  56.9 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1460  nitrogenase-associated protein  58.46 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0145  nitrogenase-associated protein  53.15 
 
 
143 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776739  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2351  nitrogenase-associated protein  59.2 
 
 
142 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1452  nitrogenase-associated protein  55.08 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5881  putative arsenate reductase (nitrogenase-associated protein)  48.57 
 
 
139 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0819125  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51030  nitrogenase-associated protein  57.28 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0511057  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2105  nitrogenase-associated protein  50.86 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.980388  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1555  nitrogenase-associated protein  45.16 
 
 
137 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.65637  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1650  nitrogenase-associated protein  47.41 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0911  nitrogenase-associated protein  44.83 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29330  hypothetical protein  49.12 
 
 
142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1060  nitrogenase-associated protein  40.95 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.0000873052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  28.57 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  32.14 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  28.32 
 
 
116 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  25.89 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2271  arsenate reductase  33.68 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  30.43 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  26.79 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  29.25 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  23.42 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  26.79 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  28.32 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  23.28 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  26.72 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  26.72 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  29.47 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  26.72 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  28.07 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3411  transcriptional regulator Spx  24.78 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000835539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  29.52 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  42.11 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  26.72 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  26.72 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  26.72 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  26.79 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  28.07 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  23.28 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  26.72 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  24.78 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  22.41 
 
 
116 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  26.79 
 
 
117 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  22.32 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  26.55 
 
 
117 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  22.41 
 
 
116 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  29.63 
 
 
115 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  30.11 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  23.08 
 
 
121 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  29.79 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  28.7 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  22.32 
 
 
116 aa  40.8  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  28.32 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  23.42 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1835  transcriptional regulator Spx  24.78 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.27338  normal  0.376442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  40 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  24.11 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  27.84 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  22.32 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3422  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3456  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3109  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3181  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3202  transcriptional regulator Spx  23.89 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0489409  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1181  arsenate reductase  26.8 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2278  arsenate reductase and related protein  26.67 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  23.53 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  25.45 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02143  putative arsenate reductase ArsC  24.78 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0470419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  32.14 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0718  arsenate reductase  27.55 
 
 
141 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0377236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>