63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5881 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5881  putative arsenate reductase (nitrogenase-associated protein)  100 
 
 
139 aa  285  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0819125  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0145  nitrogenase-associated protein  62.59 
 
 
143 aa  177  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776739  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1764  nitrogenase-associated protein  52.52 
 
 
141 aa  144  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2631  nitrogenase-associated protein  50.71 
 
 
157 aa  142  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1772  nitrogenase-associated protein  48.85 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1800  nitrogenase-associated protein  48.85 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.663505  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0471  nitrogenase-associated protein  48.91 
 
 
141 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3773  nitrogenase-associated protein  55.45 
 
 
144 aa  134  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4315  nitrogenase-associated protein  55.45 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00428414  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1192  nitrogenase-associated protein  55.26 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1840  nitrogenase-associated protein  44.12 
 
 
148 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0223  nitrogenase-associated protein  48.57 
 
 
145 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51030  nitrogenase-associated protein  48.76 
 
 
147 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0511057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1186  nitrogenase-associated protein  53.64 
 
 
130 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4806  nitrogenase-associated protein  51.89 
 
 
141 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1007  nitrogenase-associated protein  43.48 
 
 
143 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2504  nitrogenase-associated protein  51.89 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1054  nitrogenase-associated protein  52.34 
 
 
130 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  46.76 
 
 
462 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  46.76 
 
 
462 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0427  nitrogenase-associated protein  42.66 
 
 
143 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0451  nitrogenase-associated protein  49.28 
 
 
171 aa  116  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1208  nitrogenase-associated protein  48.18 
 
 
146 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1650  nitrogenase-associated protein  49.06 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1555  nitrogenase-associated protein  42.34 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.65637  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2105  nitrogenase-associated protein  39.01 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.980388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0511  nitrogenase-associated protein  48.18 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0911  nitrogenase-associated protein  47.17 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1460  nitrogenase-associated protein  51.89 
 
 
161 aa  105  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29330  hypothetical protein  45.22 
 
 
142 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1452  nitrogenase-associated protein  49.12 
 
 
159 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2351  nitrogenase-associated protein  53.64 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1060  nitrogenase-associated protein  39.2 
 
 
132 aa  93.6  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.0000873052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  32.29 
 
 
140 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  30.21 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2198  arsenate reductase  31.63 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  26.32 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0237  arsenate reductase and related  26.17 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.323435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  29.41 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1485  arsenate reductase  27.43 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000184523  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  25.44 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2271  arsenate reductase  30.53 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15090  hypothetical protein  27.78 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.737886  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  28.45 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  29.47 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3085  arsenate reductase and related protein  26.42 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3587  arsenate reductase and related  27.05 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000181597  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2504  arsenate reductase and related  25.45 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5134  hypothetical protein  24.17 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5098  hypothetical protein  24.17 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5229  hypothetical protein  24.17 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000111635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4717  arsenate reductase  24.17 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000794506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4701  arsenate reductase  24.17 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000403452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4860  hypothetical protein  24.17 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00587583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5131  hypothetical protein  24.17 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000307731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5136  hypothetical protein  24.17 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00116769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0104  hypothetical protein  24.17 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000725895  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  25.96 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  25.96 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4815  arsenate reductase and related  24.17 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000608235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  28.16 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  40 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  28.42 
 
 
162 aa  40  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>