36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2504 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2504  nitrogenase-associated protein  100 
 
 
137 aa  280  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0511  nitrogenase-associated protein  77.78 
 
 
149 aa  222  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3773  nitrogenase-associated protein  54.68 
 
 
144 aa  160  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1192  nitrogenase-associated protein  62.71 
 
 
131 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1186  nitrogenase-associated protein  62.39 
 
 
130 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1054  nitrogenase-associated protein  58.68 
 
 
130 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4315  nitrogenase-associated protein  58.97 
 
 
145 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00428414  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1772  nitrogenase-associated protein  52.31 
 
 
133 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1800  nitrogenase-associated protein  52.31 
 
 
133 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.663505  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0223  nitrogenase-associated protein  54.41 
 
 
145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0471  nitrogenase-associated protein  51.18 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1840  nitrogenase-associated protein  49.26 
 
 
148 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1764  nitrogenase-associated protein  52.71 
 
 
141 aa  140  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2631  nitrogenase-associated protein  55.08 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4806  nitrogenase-associated protein  50.36 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1555  nitrogenase-associated protein  47.69 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.65637  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2105  nitrogenase-associated protein  45.65 
 
 
150 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.980388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1208  nitrogenase-associated protein  52.99 
 
 
146 aa  133  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1007  nitrogenase-associated protein  48.46 
 
 
143 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0451  nitrogenase-associated protein  57.26 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0145  nitrogenase-associated protein  56.52 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776739  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51030  nitrogenase-associated protein  50.94 
 
 
147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0511057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1452  nitrogenase-associated protein  48.06 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1650  nitrogenase-associated protein  47.41 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1460  nitrogenase-associated protein  48.74 
 
 
161 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556054 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0911  nitrogenase-associated protein  40.58 
 
 
148 aa  120  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5881  putative arsenate reductase (nitrogenase-associated protein)  51.89 
 
 
139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0819125  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  43.38 
 
 
462 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  43.38 
 
 
462 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0427  nitrogenase-associated protein  42.24 
 
 
143 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2351  nitrogenase-associated protein  50 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29330  hypothetical protein  50 
 
 
142 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1060  nitrogenase-associated protein  38.68 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.0000873052 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2271  arsenate reductase  30 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3085  arsenate reductase and related protein  27.52 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  28.7 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>