60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1007 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1007  nitrogenase-associated protein  100 
 
 
143 aa  296  8e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1840  nitrogenase-associated protein  53.9 
 
 
148 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3773  nitrogenase-associated protein  51.06 
 
 
144 aa  159  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2631  nitrogenase-associated protein  57.5 
 
 
157 aa  157  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4315  nitrogenase-associated protein  59.48 
 
 
145 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00428414  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4806  nitrogenase-associated protein  51.8 
 
 
141 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1772  nitrogenase-associated protein  52.31 
 
 
133 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1800  nitrogenase-associated protein  52.31 
 
 
133 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.663505  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1192  nitrogenase-associated protein  54.33 
 
 
131 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1186  nitrogenase-associated protein  56.9 
 
 
130 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1764  nitrogenase-associated protein  51.47 
 
 
141 aa  147  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0223  nitrogenase-associated protein  58.62 
 
 
145 aa  144  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1555  nitrogenase-associated protein  48.51 
 
 
137 aa  142  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.65637  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  60 
 
 
462 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1054  nitrogenase-associated protein  50.39 
 
 
130 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  60 
 
 
462 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1208  nitrogenase-associated protein  46.53 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0471  nitrogenase-associated protein  47.48 
 
 
141 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0427  nitrogenase-associated protein  47.76 
 
 
143 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2504  nitrogenase-associated protein  48.46 
 
 
137 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0511  nitrogenase-associated protein  46.92 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0451  nitrogenase-associated protein  53.45 
 
 
171 aa  130  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1650  nitrogenase-associated protein  50.43 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0145  nitrogenase-associated protein  50.38 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776739  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2105  nitrogenase-associated protein  43.48 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.980388  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0911  nitrogenase-associated protein  46.85 
 
 
148 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1452  nitrogenase-associated protein  47.79 
 
 
159 aa  127  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5881  putative arsenate reductase (nitrogenase-associated protein)  43.48 
 
 
139 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0819125  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2351  nitrogenase-associated protein  55.17 
 
 
142 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1460  nitrogenase-associated protein  47.79 
 
 
161 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51030  nitrogenase-associated protein  46.67 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0511057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1060  nitrogenase-associated protein  46.15 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.0000873052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29330  hypothetical protein  41.94 
 
 
142 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1485  arsenate reductase  27.62 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000184523  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  26.13 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  27.55 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0237  arsenate reductase and related  27.62 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.323435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  25.71 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  28.28 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  26.53 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4815  arsenate reductase and related  26.17 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000608235  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  26.67 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2504  arsenate reductase and related  26.32 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  29.25 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0104  hypothetical protein  26.17 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000725895  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5136  hypothetical protein  26.17 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00116769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4860  hypothetical protein  26.17 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00587583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5131  hypothetical protein  26.17 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000307731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4701  arsenate reductase  26.17 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000403452  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5229  hypothetical protein  26.17 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000111635  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5098  hypothetical protein  26.17 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4717  arsenate reductase  26.17 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000794506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5134  hypothetical protein  26.17 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  25.83 
 
 
124 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  25.83 
 
 
124 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  24.76 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  25.83 
 
 
124 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  25.83 
 
 
124 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0838  arsenate reductase  23.64 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0227147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  26.17 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>