202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1372 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1372  heat shock protein HSP20  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  56.8 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  55.65 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  55.2 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  58.06 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  54.84 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  55.2 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  55.2 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  55.2 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  56.45 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  56.8 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  55.2 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  54.84 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  56.45 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  53.23 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  53.23 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  54.84 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  56.45 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  54.89 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  52.76 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  52.42 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  57.48 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  50.81 
 
 		 141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  50.81 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  52.14 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  48.72 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  47.2 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  48 
 
 		 182 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  46.03 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  44.8 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  42.96 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  46.83 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  42.97 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  39.32 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2073  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1322  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  43.93 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  40.65 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  40.46 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4311  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 153 aa  84.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4551  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 153 aa  84.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.448918  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  37.7 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  42.27 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  42.86 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  43.59 
 
 		 176 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  39.34 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  39.34 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  39.34 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  43.3 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  38.6 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  39.34 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  42.27 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  39.34 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  42.27 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  37.37 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  43.3 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  41.9 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  36.04 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  38.52 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  38.52 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  38.52 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  38.05 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  46.24 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  38.52 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  38.52 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  38.52 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  38.52 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  38.52 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  43.43 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  42.2 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  40.57 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2830  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0456781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1531  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.217499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  38.05 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  38.05 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  38.05 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0384  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  37.4 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.272184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>