213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0049 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  81.82 
 
 		 141 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  81.12 
 
 		 141 aa  238  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  75.52 
 
 		 141 aa  222  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  73.43 
 
 		 160 aa  221  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  73.43 
 
 		 160 aa  221  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  72.03 
 
 		 140 aa  217  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  64.34 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  65.73 
 
 		 141 aa  193  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  66.43 
 
 		 141 aa  193  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  64.34 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  65.28 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  65.03 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  65.03 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  63.38 
 
 		 143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  63.38 
 
 		 143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  62.68 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  65 
 
 		 141 aa  186  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  62.5 
 
 		 144 aa  185  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  64.54 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  63.12 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  62.14 
 
 		 148 aa  178  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  59.86 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  56.64 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  56.03 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  56.74 
 
 		 182 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  57.35 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  54.61 
 
 		 136 aa  147  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  55.63 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  56.3 
 
 		 167 aa  146  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  56.03 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1372  heat shock protein HSP20  52.76 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  53.47 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  50.35 
 
 		 155 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  49.65 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  49.65 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  48.51 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  51.59 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  51.61 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  47.01 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  47.01 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  47.01 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  47.01 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  49.18 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  49.62 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  47.33 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  47.93 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  45.32 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  43.28 
 
 		 160 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  45.86 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  47.73 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  47.01 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  47.01 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  45.08 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  48.09 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  43.66 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0614  Hsp20/alpha crystallin family protein  42.96 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300096  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  45.8 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  46.1 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2141  global stress protein GspA  43.08 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  44.09 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  46.56 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  44.53 
 
 		 176 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  43.17 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  46.56 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  45.97 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5227  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0487576  normal  0.385827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  42.36 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0384  heat shock protein Hsp20  44.2 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2116  global stress protein GspA  43.08 
 
 		 166 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  48.09 
 
 		 159 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  48 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3877  heat shock protein Hsp20  47.22 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.446606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  44.19 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  41.54 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  42.54 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  43.65 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  42.54 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  42.74 
 
 		 160 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  43.31 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  43.31 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  41.27 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  43.31 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3145  heat shock protein Hsp20  44.62 
 
 		 182 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  42.54 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  41.94 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>