231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1572 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  94.19 
 
 		 155 aa  293  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  72.46 
 
 		 147 aa  214  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  70.63 
 
 		 172 aa  211  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  67.65 
 
 		 137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  69.34 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  59.7 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  55.94 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  58.7 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  56.15 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  52.86 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  52.86 
 
 		 143 aa  147  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  54.01 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  52.14 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  52.14 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  52.14 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  52.86 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  53.57 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  52.86 
 
 		 141 aa  140  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  52.17 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  51.43 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  51.08 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  48.92 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  49.65 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  49.65 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  50.69 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  50.69 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  48.92 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  49.64 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  48.57 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  48.92 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  49.29 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  49.65 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  47.83 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  52.54 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  47.18 
 
 		 143 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  49.23 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  49.57 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  49.57 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  48.28 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  48.15 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  49.57 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  51.28 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  49.57 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  48.36 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  49.62 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  49.57 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  49.57 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  48.72 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  48.72 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  50.43 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  48.72 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  47.41 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  47.41 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  47.41 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  48.28 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  50.43 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  48.06 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  46.76 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  43.92 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  49.24 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  46.32 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  44.53 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 		 176 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2073  heat shock protein Hsp20  47.79 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1322  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  45.38 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  49.24 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  49.58 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  46.55 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3580  chaperone protein IbpA  46.03 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  54.7 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  47.41 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  46.96 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  46.96 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  44.37 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  46.96 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  46.96 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  46.96 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  47.86 
 
 		 139 aa  117  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  46.96 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  46.96 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  49.57 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  46.96 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  46.96 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  46.96 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  46.96 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  46.96 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  46.96 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  46.96 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  49.62 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  44.27 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  47.86 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  47.86 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  47.41 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  47.41 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>