235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1116 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
152 aa  313  4e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  64.9 
 
 
154 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4311  heat shock protein Hsp20  64.71 
 
 
153 aa  202  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4551  heat shock protein Hsp20  64.71 
 
 
153 aa  202  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.448918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  61.74 
 
 
149 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  61.22 
 
 
150 aa  187  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2073  heat shock protein Hsp20  53.95 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1322  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  54.3 
 
 
168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2830  heat shock protein Hsp20  54.19 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0456781 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4626  heat shock protein Hsp20  51.27 
 
 
159 aa  160  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  52.7 
 
 
153 aa  160  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  48.67 
 
 
158 aa  157  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  52.29 
 
 
153 aa  157  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0763  heat shock protein Hsp20  53.85 
 
 
158 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  50.65 
 
 
157 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  54.29 
 
 
158 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  56.64 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  57.34 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  52.45 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  57.34 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  53.79 
 
 
159 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1531  heat shock protein Hsp20  48.39 
 
 
156 aa  153  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.217499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  52.78 
 
 
159 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  53.79 
 
 
155 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1754  heat shock protein Hsp20  47.17 
 
 
160 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.19811  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  53.79 
 
 
155 aa  151  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5227  heat shock protein Hsp20  48.1 
 
 
158 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0487576  normal  0.385827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  48.97 
 
 
152 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  50.33 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3145  heat shock protein Hsp20  49.33 
 
 
182 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  53.33 
 
 
154 aa  150  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  52.9 
 
 
145 aa  150  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6473  heat shock protein Hsp20  48.37 
 
 
156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436794  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  50.7 
 
 
155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  48.68 
 
 
156 aa  149  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  51.39 
 
 
158 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  48.32 
 
 
160 aa  148  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  52.55 
 
 
147 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  52.55 
 
 
147 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  52.55 
 
 
147 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  52.55 
 
 
147 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  53.15 
 
 
165 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  51.47 
 
 
145 aa  147  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  50.74 
 
 
156 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  47.68 
 
 
160 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 
154 aa  147  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  49.66 
 
 
148 aa  147  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2202  heat shock protein Hsp20  52.6 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  48.1 
 
 
160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  51.85 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  50.74 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  51.85 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  51.85 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  51.85 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  50.36 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  51.09 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  50.36 
 
 
158 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  50 
 
 
145 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  50.35 
 
 
158 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  52.99 
 
 
146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  51.68 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  50.67 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2715  heat shock protein Hsp20  51.33 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298562  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  50.67 
 
 
167 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2501  heat shock protein Hsp20  48.97 
 
 
158 aa  144  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5641  heat shock protein Hsp20  45.22 
 
 
157 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41012  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  49.28 
 
 
155 aa  144  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  47.37 
 
 
156 aa  143  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  51.8 
 
 
144 aa  143  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  50.37 
 
 
147 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  51.11 
 
 
160 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  51.11 
 
 
160 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  51.11 
 
 
147 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  50.75 
 
 
145 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1214  heat shock protein Hsp20  47.06 
 
 
155 aa  141  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  51.11 
 
 
146 aa  140  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5555  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 
158 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148025 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  51.09 
 
 
169 aa  140  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
153 aa  139  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  51.05 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02239  small heat shock protein  45.77 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  47.41 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3877  heat shock protein Hsp20  46.79 
 
 
159 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.446606 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0614  Hsp20/alpha crystallin family protein  49.26 
 
 
154 aa  138  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300096  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  50.38 
 
 
148 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2891  heat shock protein Hsp20  46.38 
 
 
154 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.457656  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0384  heat shock protein Hsp20  48.59 
 
 
169 aa  135  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502047  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 
153 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1513  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3580  chaperone protein IbpA  46.98 
 
 
156 aa  134  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1545  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
147 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
156 aa  133  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  51.13 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  48.53 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  51.13 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3816  heat shock protein Hsp20  45.81 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3777  heat shock protein Hsp20  44.14 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.732741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2006  heat-shock protein IbpA  44.14 
 
 
149 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1982  heat shock protein Hsp20  44.14 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.01007  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23680  heat-shock protein IbpA  44.14 
 
 
149 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>