216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1748 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  98.64 
 
 		 147 aa  294  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  96.6 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  96.6 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  97.95 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  96.6 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  96.6 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  86.9 
 
 		 145 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  85.03 
 
 		 147 aa  257  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  84.25 
 
 		 146 aa  258  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  86.81 
 
 		 147 aa  256  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  81.51 
 
 		 146 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  84.17 
 
 		 148 aa  244  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  76.67 
 
 		 150 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  59.59 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  59.03 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  63.31 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  59.15 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  58.04 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  59.72 
 
 		 145 aa  174  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  57.64 
 
 		 145 aa  174  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  60.58 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  62.32 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  62.32 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  62.32 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  62.32 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  62.32 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  62.32 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  62.32 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  62.32 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  62.32 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  60.56 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  59.15 
 
 		 159 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  60.14 
 
 		 139 aa  170  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2891  heat shock protein Hsp20  56 
 
 		 154 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.457656  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  59.86 
 
 		 156 aa  169  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  61.59 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  54.11 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  59.85 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  61.59 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  61.59 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4105  heat shock protein IbpA  61.31 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  59.85 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  61.59 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  61.59 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  59.85 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  60.58 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  60.58 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0763  heat shock protein Hsp20  58.87 
 
 		 158 aa  167  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  59.15 
 
 		 159 aa  167  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  57.97 
 
 		 148 aa  167  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  59.15 
 
 		 158 aa  166  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  55.56 
 
 		 157 aa  166  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  54.01 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  54.01 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3580  chaperone protein IbpA  56.29 
 
 		 156 aa  163  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  57.86 
 
 		 160 aa  163  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  51.7 
 
 		 164 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3914  heat shock protein IbpA  59.12 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  57.25 
 
 		 160 aa  163  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  60.87 
 
 		 136 aa  163  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  58.16 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  60.14 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  58.16 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  56.64 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  57.14 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  58.16 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  57.04 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2505  heat shock protein Hsp20  55.4 
 
 		 153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  53.19 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4311  heat shock protein Hsp20  54.35 
 
 		 153 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4551  heat shock protein Hsp20  54.35 
 
 		 153 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.448918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  55 
 
 		 155 aa  159  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02239  small heat shock protein  54.36 
 
 		 151 aa  159  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  53.96 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3816  heat shock protein Hsp20  52.41 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  59.42 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  55.07 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1214  heat shock protein Hsp20  58.22 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  54.29 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  56.34 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  53.62 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  54.29 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  54.29 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  51.82 
 
 		 167 aa  154  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  50.35 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  51.82 
 
 		 162 aa  154  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  52.9 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  55.63 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  53.28 
 
 		 153 aa  153  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5227  heat shock protein Hsp20  53.19 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0487576  normal  0.385827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  52.9 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3877  heat shock protein Hsp20  53.19 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.446606 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4626  heat shock protein Hsp20  52.38 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6473  heat shock protein Hsp20  55.8 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  54.01 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  52.55 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2202  heat shock protein Hsp20  55.47 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>