255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0872 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  89.94 
 
 		 158 aa  288  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  86.16 
 
 		 158 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0763  heat shock protein Hsp20  83.54 
 
 		 158 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  87.33 
 
 		 153 aa  262  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  85.33 
 
 		 153 aa  256  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  78.75 
 
 		 159 aa  255  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  69.38 
 
 		 161 aa  223  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3877  heat shock protein Hsp20  63.29 
 
 		 159 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.446606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  67.09 
 
 		 155 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  66.46 
 
 		 155 aa  207  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  65.82 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  65.82 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  65.19 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  63.06 
 
 		 165 aa  202  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  64.24 
 
 		 160 aa  201  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  55.63 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  57.05 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  59.06 
 
 		 168 aa  183  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  57.62 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2715  heat shock protein Hsp20  58.71 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  54.84 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  58.55 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  59.74 
 
 		 169 aa  177  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  53.46 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  59.86 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  59.86 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  59.86 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  59.86 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  59.15 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  59.15 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  59.15 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  59.86 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  59.15 
 
 		 147 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  52.6 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  57.45 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  60.84 
 
 		 154 aa  168  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  56.74 
 
 		 158 aa  167  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  58.16 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  54.29 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  58.45 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  51.97 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  58.9 
 
 		 148 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  54.29 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  51.92 
 
 		 154 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  53.57 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  57.04 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  54.19 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  56.03 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1214  heat shock protein Hsp20  58.74 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  57.04 
 
 		 146 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  56.34 
 
 		 146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0614  Hsp20/alpha crystallin family protein  51.61 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300096  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  50.34 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  53.57 
 
 		 139 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  55.32 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2830  heat shock protein Hsp20  50.33 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0456781 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6473  heat shock protein Hsp20  53.47 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  51.68 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  51.01 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4311  heat shock protein Hsp20  50.94 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4551  heat shock protein Hsp20  50.94 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.448918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  48.48 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  49.68 
 
 		 167 aa  157  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  49.68 
 
 		 162 aa  156  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  54.11 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1531  heat shock protein Hsp20  51.72 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.217499 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  55.63 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2073  heat shock protein Hsp20  48 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1322  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  52.78 
 
 		 152 aa  153  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  54.29 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  54.29 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  54.29 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  54.29 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  54.29 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  54.29 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  54.29 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3914  heat shock protein IbpA  53.24 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4626  heat shock protein Hsp20  51.72 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  54.29 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  54.29 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  53.57 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  53.57 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  53.57 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  53.57 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3816  heat shock protein Hsp20  48.17 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  52.82 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  52.11 
 
 		 137 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  53.57 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  50.62 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5227  heat shock protein Hsp20  49.37 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0487576  normal  0.385827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  48.41 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  55 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  55 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  46.2 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  52.48 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2891  heat shock protein Hsp20  50.35 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.457656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  48.92 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  48.92 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>