220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0182 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 141 aa  287  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  98.58 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  96.45 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  94.33 
 
 		 141 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  91.49 
 
 		 141 aa  267  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  90.78 
 
 		 141 aa  266  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  89.51 
 
 		 143 aa  261  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  71.13 
 
 		 144 aa  207  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  69.72 
 
 		 143 aa  207  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  71.22 
 
 		 143 aa  207  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  71.22 
 
 		 143 aa  207  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  71.94 
 
 		 166 aa  206  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  70.42 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  70.29 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  65.94 
 
 		 141 aa  197  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  69.78 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  65.94 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  65.28 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  65.22 
 
 		 140 aa  186  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  63.31 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  60.99 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  64.96 
 
 		 160 aa  184  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  64.96 
 
 		 160 aa  184  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  53.96 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  58.27 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  59.4 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  58.52 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  53.24 
 
 		 172 aa  145  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  53.57 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  53.24 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1372  heat shock protein HSP20  55.2 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  50.7 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  45.07 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  49.64 
 
 		 155 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  49.64 
 
 		 155 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  48.92 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  47.5 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  47.11 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  48 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 		 176 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  44.54 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  45.74 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  44.54 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  47.06 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  45.38 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  45 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  44.26 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  47.93 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  47.93 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  44.17 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  45.04 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  44.17 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  47.06 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  43.8 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  42.75 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  44.17 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  41.67 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  42.62 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  45.45 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  46.28 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 		 157 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0614  Hsp20/alpha crystallin family protein  42.75 
 
 		 154 aa  98.6  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300096  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  43.7 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  45.9 
 
 		 161 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  43.7 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  46.28 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  46.28 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  43.33 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  43.22 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  43.7 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  43.9 
 
 		 168 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  43.8 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  44.54 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  44.54 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  44.54 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4105  heat shock protein IbpA  43.7 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  44.54 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  44.54 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  44.54 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  44.54 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  44.54 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  44.54 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4233  heat shock chaperone IbpB  40 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  45.76 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4197  heat shock chaperone IbpB  40.44 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4139  heat shock chaperone IbpB  40.44 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>