237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0188 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  64.75 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  64.03 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  63.31 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  64.03 
 
 		 141 aa  186  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  63.77 
 
 		 141 aa  184  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  62.59 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  62.59 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  63.5 
 
 		 140 aa  182  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  63.04 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  63.77 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  64.14 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  62.04 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  64.14 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  62.04 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  63.45 
 
 		 143 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  61.7 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  62.14 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  64.03 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  61.81 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  64.79 
 
 		 182 aa  176  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  61.15 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  61.59 
 
 		 167 aa  173  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  62.59 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  62.32 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  61.87 
 
 		 162 aa  166  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  60.71 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  59.15 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  59.85 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  58.7 
 
 		 141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  58.7 
 
 		 155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  58.7 
 
 		 155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  60 
 
 		 141 aa  159  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  58.7 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  54.61 
 
 		 142 aa  150  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1372  heat shock protein HSP20  50.81 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  48.84 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  47.76 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  49.14 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  47.66 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  47.62 
 
 		 136 aa  110  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  44.9 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  42.19 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  47.24 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  47.24 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  48.03 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  47.24 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  47.66 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  47.24 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  48.03 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  45.67 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  47.66 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  47.24 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  47.24 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  46.09 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  47.24 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  47.24 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  48.03 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  47.66 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  47.24 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  47.66 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  47.66 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  48.03 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  46.51 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  46.04 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  47.69 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  44.36 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  44.96 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  45.04 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  46.56 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  48.03 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4105  heat shock protein IbpA  46.55 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  48.03 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  45.8 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  46.43 
 
 		 159 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  45.99 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  45.8 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  45.8 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  45.8 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  45.8 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  46.72 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  42.14 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2073  heat shock protein Hsp20  48.89 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1322  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  43.7 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  45.8 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  47.01 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  44.96 
 
 		 147 aa  103  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  43.31 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  43.31 
 
 		 162 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  44.29 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  44.83 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  46.88 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  44.27 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>