211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4228 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
144 aa  286  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  96.53 
 
 
144 aa  280  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  85.21 
 
 
143 aa  253  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  84.51 
 
 
143 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  84.51 
 
 
143 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  87.23 
 
 
142 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  75.36 
 
 
141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  71.13 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  70.42 
 
 
166 aa  208  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  71.13 
 
 
141 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  71.13 
 
 
141 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  71.74 
 
 
141 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  73.19 
 
 
141 aa  204  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  72.86 
 
 
143 aa  200  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  67.61 
 
 
140 aa  193  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  63.31 
 
 
141 aa  191  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  63.31 
 
 
141 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  63.38 
 
 
141 aa  189  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  64.79 
 
 
160 aa  188  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  64.79 
 
 
160 aa  188  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  67.61 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  63.12 
 
 
143 aa  185  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  64.03 
 
 
148 aa  177  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  60.9 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  60.9 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  57.75 
 
 
182 aa  156  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  51.77 
 
 
172 aa  155  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  54.86 
 
 
147 aa  154  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  55.63 
 
 
136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  53.57 
 
 
155 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  52.86 
 
 
155 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  52.86 
 
 
155 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  53.24 
 
 
137 aa  147  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  54.17 
 
 
141 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1372  heat shock protein HSP20  55.2 
 
 
132 aa  144  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  50.35 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  49.62 
 
 
146 aa  117  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  47.41 
 
 
147 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  48.09 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  44.96 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  47.76 
 
 
147 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  43.61 
 
 
144 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
147 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  45.8 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  45.8 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  45.8 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  46.56 
 
 
147 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  45.77 
 
 
156 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  43.61 
 
 
145 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
160 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  43.61 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  48.15 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  44.85 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  47.29 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  48.15 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  44.27 
 
 
154 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  46.4 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  47.76 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  45.86 
 
 
149 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  42.11 
 
 
145 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 
158 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  46.92 
 
 
176 aa  104  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4311  heat shock protein Hsp20  46.09 
 
 
153 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4551  heat shock protein Hsp20  46.09 
 
 
153 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.448918  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
153 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  47.73 
 
 
155 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 
156 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 
156 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  43.75 
 
 
137 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
137 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  43.75 
 
 
137 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  43.75 
 
 
137 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  43.75 
 
 
137 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 
156 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  43.75 
 
 
137 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  43.75 
 
 
137 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  43.75 
 
 
137 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  43.75 
 
 
137 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 
153 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  44.7 
 
 
169 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  45.74 
 
 
160 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  46.97 
 
 
155 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  45.74 
 
 
160 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  47.06 
 
 
153 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  42.97 
 
 
137 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
158 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2501  heat shock protein Hsp20  46.62 
 
 
158 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5227  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
158 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0487576  normal  0.385827 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  42.97 
 
 
137 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  44.19 
 
 
139 aa  100  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  47.11 
 
 
158 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  42.97 
 
 
137 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  42.97 
 
 
137 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>