185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1920 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
59 aa  113  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.40377  hitchhiker  0.00000044122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1555  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  68.42 
 
 
58 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136949  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  51.06 
 
 
63 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  54.55 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.83 
 
 
62 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  60 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  50 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.11 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  66.67 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.64 
 
 
67 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  41.07 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  49.12 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.37 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.37 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  56 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.23 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.1 
 
 
103 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.37 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  50 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  54 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.65 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.1 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.85 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.86 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.54 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60.53 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.86 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  42.11 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.11 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  44.64 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.45 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  53.85 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  40.68 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  55.1 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0773  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.86 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0133448 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.85 
 
 
63 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  46.34 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  45.65 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  47.83 
 
 
57 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  46 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  46 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  46 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  52.5 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  46 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  46 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  46 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  46 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  46 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.86 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.98 
 
 
94 aa  47.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.68 
 
 
62 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  45.28 
 
 
73 aa  47.4  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
84 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
84 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
84 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
84 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 
84 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4185  twin arginine-targeting protein translocase  35.71 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  44.68 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  44.68 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  44.68 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  33.93 
 
 
56 aa  45.4  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  41.27 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.94 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.51 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  39.58 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  35.42 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  40.35 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  44.23 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  40.35 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0251  twin arginine-targeting protein translocase  44.68 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.293668 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  41.51 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  39.29 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  42.22 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  46.3 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  37.25 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  48.94 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1024  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60.78 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.41106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  42 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1769  twin-arginine translocation protein TatA/E  48.39 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0412  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.14 
 
 
78 aa  43.5  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.65 
 
 
81 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
90 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0876  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.53 
 
 
43 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.697469  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  35.42 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>