More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0558 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0558  DnaJ-class molecular chaperone  100 
 
 
177 aa  350  5e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1823  heat shock protein DnaJ-like protein  59.42 
 
 
345 aa  84.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0279847  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1999  heat shock protein DnaJ  61.29 
 
 
394 aa  78.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3117  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.05 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  0.291751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2287  heat shock protein DnaJ domain protein  56.92 
 
 
125 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1135  heat shock protein DnaJ-like  40 
 
 
295 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.379333  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
380 aa  62.8  0.000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.95 
 
 
436 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  42.42 
 
 
314 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
378 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
382 aa  59.3  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  42.19 
 
 
298 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
362 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2059  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
376 aa  58.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4917  heat shock protein DnaJ, N-terminal  42.47 
 
 
341 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34896  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
375 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
376 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.11 
 
 
325 aa  57.8  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
378 aa  57.4  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
378 aa  57.4  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  38.89 
 
 
339 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
378 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
376 aa  57.4  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5363  DnaJ domain protein  42.47 
 
 
337 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0337  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
379 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  40.62 
 
 
335 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0266  heat shock protein DnaJ-like  32.85 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
379 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  40.62 
 
 
371 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
379 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
374 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
386 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
377 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
376 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
374 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.27 
 
 
324 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  42.19 
 
 
376 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
376 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
378 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
379 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
379 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
376 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.81 
 
 
315 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
379 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
379 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
379 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
374 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
379 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
376 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
376 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
376 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
359 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  42.19 
 
 
376 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1396  chaperone protein DnaJ  35.94 
 
 
373 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.427983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1276  chaperone protein DnaJ  35.94 
 
 
374 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
379 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  39.44 
 
 
375 aa  55.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
385 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
387 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
387 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  37.31 
 
 
311 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3476  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.91 
 
 
291 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00429307  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
378 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0465  chaperone protein DnaJ  35.94 
 
 
374 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  39.06 
 
 
333 aa  55.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
376 aa  55.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  41.27 
 
 
401 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0451  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
375 aa  55.5  0.0000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1972  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
374 aa  55.5  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
377 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
373 aa  55.1  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
377 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0737  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.649891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1249  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
380 aa  55.1  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38744  normal  0.199724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
377 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
379 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
377 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  34.38 
 
 
374 aa  55.1  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
373 aa  55.1  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0370  chaperone protein DnaJ  39.71 
 
 
372 aa  55.1  0.0000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.980316  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  38.24 
 
 
379 aa  55.1  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
376 aa  54.7  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
372 aa  54.7  0.0000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  35.82 
 
 
333 aa  54.7  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
376 aa  54.7  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1183  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
377 aa  54.3  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000246856  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
376 aa  54.3  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
377 aa  54.3  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
383 aa  54.3  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
378 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
380 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  35.71 
 
 
311 aa  53.9  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0710  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.62 
 
 
270 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
377 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2053  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
378 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.519265  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
382 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
373 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
377 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
377 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
377 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>