166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4036 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4036  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5606  cyclic nucleotide-binding protein  94.7 
 
 		 241 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4966  cyclic nucleotide-binding protein  51.95 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.916319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2074  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.11 
 
 		 246 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.83722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.84 
 
 		 246 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  37.84 
 
 		 246 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2120  cyclic nucleotide-binding  40.13 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2397  cyclic nucleotide-binding protein  39.47 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 244 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3386  cyclic nucleotide-binding protein  37.25 
 
 		 237 aa  101  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 244 aa  101  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0061  cyclic nucleotide-binding protein  37.25 
 
 		 237 aa  101  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.08 
 
 		 244 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3012  cyclic nucleotide-binding protein  37.42 
 
 		 242 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791421  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0075  hypothetical protein  37.25 
 
 		 237 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 250 aa  97.8  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0784  hypothetical protein  37.25 
 
 		 237 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 267 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 267 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 238 aa  95.5  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1834  cyclic nucleotide-binding protein  35.95 
 
 		 241 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0789  cyclic nucleotide-binding  36.18 
 
 		 240 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.424436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 243 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 239 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 243 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 243 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  91.3  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 239 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 239 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 246 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0788  cyclic nucleotide-binding  35.53 
 
 		 236 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  31.87 
 
 		 439 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6128  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.31 
 
 		 236 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  35.81 
 
 		 238 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 242 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3376  cyclic nucleotide-binding protein  34.87 
 
 		 236 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 245 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.14 
 
 		 256 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 263 aa  87.8  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  32.69 
 
 		 242 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 244 aa  87  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 239 aa  87  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3860  cyclic nucleotide-binding protein  39.22 
 
 		 237 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 240 aa  86.3  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 244 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 268 aa  85.5  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 232 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 239 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5720  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 267 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5843  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.69 
 
 		 254 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 232 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 239 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.23 
 
 		 232 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  33.54 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  32.7 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.87 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.53 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.33 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  30.67 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2486  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 266 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5764  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.81 
 
 		 237 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3818  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.54 
 
 		 265 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 260 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  28.95 
 
 		 258 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4306  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 236 aa  80.9  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.89 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  28.95 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2958  cyclic nucleotide-binding  33.11 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0178  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6918  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.26 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.22 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 239 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 260 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  32 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5994  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.64 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  30 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5879  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.28 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.41 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.92 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.65 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156733  normal  0.417355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 340 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5837  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.58 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1833  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>