38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1312 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1312  SWIB/MDM2 domain protein  100 
 
 		 110 aa  221  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0926  SWIB/MDM2 domain-containing protein  83.33 
 
 		 120 aa  186  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0300157  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3127  SWIB/MDM2 domain-containing protein  71.82 
 
 		 110 aa  157  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.13314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3448  SWIB/MDM2 domain protein  71.82 
 
 		 110 aa  157  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3324  SWIB/MDM2 domain protein  70.91 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3522  SWIB/MDM2 domain-containing protein  81.71 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1274  SWIB/MDM2 domain-containing protein  71.43 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0502815 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1834  SWIB/MDM2 domain protein  75.64 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4742  SWIB/MDM2 domain protein  49.48 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166438  hitchhiker  0.00240226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0747  SWIB/MDM2 domain-containing protein  58.54 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000104692  hitchhiker  0.0000000000199042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1444  SWIB/MDM2 domain protein  52.27 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2404  SWIB/MDM2 domain-containing protein  52.27 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.609198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4619  SWIB/MDM2 domain-containing protein  55 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392701  hitchhiker  0.000924002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0056  hypothetical protein  58.75 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1866  SWIB/MDM2 domain protein  53.75 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.967571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2865  SWIB/MDM2 domain-containing protein  53.75 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0745  hypothetical protein  50.6 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.352276  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32255  predicted protein  50 
 
 		 294 aa  91.3  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  53.62 
 
 		 981 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  53.62 
 
 		 981 aa  90.9  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1954  SWIB/MDM2  54.55 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0195  SWIB/MDM2 domain-containing protein  46.6 
 
 		 133 aa  89.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3086  SWIB/MDM2 domain-containing protein  50 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.275079  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2811  SWIB complex, BAF60b  53.75 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2373  SWIB/MDM2 domain-containing protein  53.16 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.460369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  52.11 
 
 		 980 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  50.7 
 
 		 975 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  46.07 
 
 		 1002 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  51.43 
 
 		 982 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  45.35 
 
 		 990 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02810  conserved hypothetical protein  33.06 
 
 		 252 aa  77.8  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  42.7 
 
 		 992 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00360  SWIB/MDM2 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02020)  39.56 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.156113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0910  SWIB/MDM2 domain-containing protein  45.33 
 
 		 76 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0796897  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  42.86 
 
 		 865 aa  60.8  0.000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61327  predicted protein  33.33 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.86289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28032  predicted protein  37.5 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307251  normal  0.690356 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10524  SWI-SNF complex subunit (BAF60b), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06310)  31.34 
 
 		 472 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>