36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0910 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0910  SWIB/MDM2 domain-containing protein  100 
 
 		 76 aa  154  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0796897  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0747  SWIB/MDM2 domain-containing protein  62.67 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000104692  hitchhiker  0.0000000000199042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0195  SWIB/MDM2 domain-containing protein  64.47 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4742  SWIB/MDM2 domain protein  58.9 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166438  hitchhiker  0.00240226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4619  SWIB/MDM2 domain-containing protein  61.33 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392701  hitchhiker  0.000924002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2865  SWIB/MDM2 domain-containing protein  61.33 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0745  hypothetical protein  54.67 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.352276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1954  SWIB/MDM2  60 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2404  SWIB/MDM2 domain-containing protein  58.67 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.609198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1444  SWIB/MDM2 domain protein  58.67 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1866  SWIB/MDM2 domain protein  61.33 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.967571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0056  hypothetical protein  58.67 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2811  SWIB complex, BAF60b  60 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2373  SWIB/MDM2 domain-containing protein  56.58 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.460369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3086  SWIB/MDM2 domain-containing protein  56 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.275079  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  54.93 
 
 		 980 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  53.52 
 
 		 992 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1274  SWIB/MDM2 domain-containing protein  50 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0502815 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1834  SWIB/MDM2 domain protein  50 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3522  SWIB/MDM2 domain-containing protein  48.65 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  50.68 
 
 		 1002 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3127  SWIB/MDM2 domain-containing protein  48 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.13314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3448  SWIB/MDM2 domain protein  48 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1312  SWIB/MDM2 domain protein  45.33 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  50.68 
 
 		 975 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  50.7 
 
 		 990 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3324  SWIB/MDM2 domain protein  47.3 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0926  SWIB/MDM2 domain-containing protein  43.24 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0300157  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  48.57 
 
 		 982 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  43.66 
 
 		 981 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  43.66 
 
 		 981 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32255  predicted protein  41.1 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02810  conserved hypothetical protein  35.82 
 
 		 252 aa  53.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  39.73 
 
 		 865 aa  52  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00360  SWIB/MDM2 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02020)  37.5 
 
 		 279 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.156113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61327  predicted protein  39.06 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.86289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>