37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61327 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_61327  predicted protein  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.86289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32255  predicted protein  47.56 
 
 		 294 aa  73.9  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02810  conserved hypothetical protein  44.93 
 
 		 252 aa  72  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00360  SWIB/MDM2 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02020)  50.82 
 
 		 279 aa  70.5  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.156113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3522  SWIB/MDM2 domain-containing protein  49.12 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3448  SWIB/MDM2 domain protein  34.83 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3127  SWIB/MDM2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.13314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1312  SWIB/MDM2 domain protein  33.33 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1954  SWIB/MDM2  42.86 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3324  SWIB/MDM2 domain protein  37.18 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0926  SWIB/MDM2 domain-containing protein  42.37 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0300157  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  44.23 
 
 		 981 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  50 
 
 		 990 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1274  SWIB/MDM2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0502815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  44.23 
 
 		 981 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2404  SWIB/MDM2 domain-containing protein  31.76 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.609198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1444  SWIB/MDM2 domain protein  31.76 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2373  SWIB/MDM2 domain-containing protein  40 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.460369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0745  hypothetical protein  38.98 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.352276  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1834  SWIB/MDM2 domain protein  38.98 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0195  SWIB/MDM2 domain-containing protein  40 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3086  SWIB/MDM2 domain-containing protein  37.7 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.275079  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4619  SWIB/MDM2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392701  hitchhiker  0.000924002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  38.67 
 
 		 975 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  44.23 
 
 		 982 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2811  SWIB complex, BAF60b  36.36 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  46.15 
 
 		 1002 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2865  SWIB/MDM2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1866  SWIB/MDM2 domain protein  40 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.967571  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0747  SWIB/MDM2 domain-containing protein  39.34 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000104692  hitchhiker  0.0000000000199042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4742  SWIB/MDM2 domain protein  36.21 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166438  hitchhiker  0.00240226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0056  hypothetical protein  35.38 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  42.31 
 
 		 980 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0910  SWIB/MDM2 domain-containing protein  39.06 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0796897  normal  0.962652 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10524  SWI-SNF complex subunit (BAF60b), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06310)  32.76 
 
 		 472 aa  43.5  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  42.31 
 
 		 992 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31243  predicted protein  27.69 
 
 		 244 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.135309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>