28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10524 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_10524  SWI-SNF complex subunit (BAF60b), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06310)  100 
 
 
472 aa  972    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649351  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02900  chromatin remodeling-related protein, putative  27.34 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84635  subunit of SWI/SNF transcription activation complex  25.23 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.157634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  36.62 
 
 
980 aa  57  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  34.29 
 
 
975 aa  57  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  37.68 
 
 
981 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  37.68 
 
 
981 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1834  SWIB/MDM2 domain protein  37.31 
 
 
108 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0550627 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32255  predicted protein  33.7 
 
 
294 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2373  SWIB/MDM2 domain-containing protein  37.14 
 
 
134 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.460369  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  35.21 
 
 
992 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1274  SWIB/MDM2 domain-containing protein  34.33 
 
 
114 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0502815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0926  SWIB/MDM2 domain-containing protein  32.84 
 
 
120 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0300157  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4742  SWIB/MDM2 domain protein  33.82 
 
 
106 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166438  hitchhiker  0.00240226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2811  SWIB complex, BAF60b  36.76 
 
 
152 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02810  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 
252 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1312  SWIB/MDM2 domain protein  31.34 
 
 
110 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 
1002 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  30.99 
 
 
990 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0195  SWIB/MDM2 domain-containing protein  36.21 
 
 
133 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0747  SWIB/MDM2 domain-containing protein  33.82 
 
 
84 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000104692  hitchhiker  0.0000000000199042 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31243  predicted protein  24.41 
 
 
244 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.135309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  32.84 
 
 
982 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1866  SWIB/MDM2 domain protein  34.33 
 
 
147 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.967571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2865  SWIB/MDM2 domain-containing protein  32.84 
 
 
101 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3522  SWIB/MDM2 domain-containing protein  30.43 
 
 
119 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61327  predicted protein  32.76 
 
 
149 aa  43.5  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.86289  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00360  SWIB/MDM2 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02020)  36.36 
 
 
279 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.156113  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>